Консорциум по секвенированию пшеницы создает новые инструменты для селекционеров

Международный консорциум по секвенированию генома пшеницы (IWGSC) объявил о начале нового проекта для ускорения обнаружения генов у пшеницы мягкой (Triticum aestivum). Проект предоставит селекционерам по всему миру важные ресурсы для ускорения программ по выведению более устойчивых сортов с повышенной толерантностью к биотическим и абиотическим стрессам.

Проект финансируется компанией BayerCropScience и Французским национальным институтом сельскохозяйственных исследований (INRA). Координатором выступает IWGSC, в работе участвуют лидеры групп по секвенированию хромосом пшеницы из 12 стран, Институт экспериментальной ботаники (Чехия), Французский центр геномных ресурсов растений (CNRGV) и компания KeyGene (Нидерланды).

Консорциум будет использовать технологию Whole Genome Profiling (WGP) от KeyGene для получения новых последовательностей, которые улучшат качество и практическую ценность физических карт для 15 хромосом. WGP доказала свою эффективность для построения высококачественных физических карт сложных геномов с высокой долей повторяющихся регионов, таких как геном пшеницы. Эти карты затем могут использоваться селекционерами для более точного картирования и клонирования генов и маркеров.

Вклад Bayer CropScience является частью обязательств компании по поддержке получения высококачественной референсной последовательности генома пшеницы. «Мы убеждены, что новые данные WGP создадут реальную ценность для исследователей, соединив генетические и физические карты», — говорит Джон Джейкобс, эксперт-ученый Bayer CropScience.

За последний год IWGSC достиг двух ключевых этапов в своей стратегии:

1. Создание черновой последовательности на основе хромосом.
2. Построение физических карт для всех хромосом.

Новый проект поможет связать эти два набора ресурсов до того, как полная референсная последовательность станет доступна в 2018 году, а также уточнит текущую работу над референсной последовательностью каждой хромосомы.

«Эти новые ресурсы будут бесценны для построения псевдомолекул и, в конечном итоге, для получения высококачественной референсной последовательности», — отмечает Этьен По из исследовательского подразделения INRA.

Конечная цель IWGSC — создание высококачественной, упорядоченной, основанной на хромосомах референсной последовательности генома пшеницы. Параллельно с этим проектом команды в 12 странах работают над референсным секвенированием 14 из 21 хромосомы пшеницы. Последовательность самой крупной хромосомы (3B) была завершена в прошлом году. Консорциум все еще ищет финансирование для секвенирования шести оставшихся хромосом. При условии получения дополнительного финансирования, высококачественная последовательность генома может стать общедоступной к 2018 году.

Пшеница — самая широко возделываемая зерновая культура в мире и основной продукт питания для более чем 35% населения планеты, обеспечивая 20% всех потребляемых калорий. Чтобы удовлетворить будущий спрос при прогнозируемом населении в 9.6 миллиарда к 2050 году, урожайность пшеницы должна ежегодно увеличиваться на 1.6%. Поскольку возможности расширения посевных площадей ограничены, а ресурсы воды и питательных веществ сокращаются, этот рост должен быть достигнут в основном за счет улучшения культур и признаков на уже обрабатываемых землях. Высококачественная референсная последовательность генома внесет значительный вклад в достижение этой цели.