Учёные секвенируют две хромосомы пшеницы

Немецкое федеральное министерство продовольствия и сельского хозяйства объявило о выделении 1,5 миллиона евро на проект по созданию референсной последовательности двух хромосом пшеницы. Работа ведётся в рамках международных усилий по расшифровке генома пшеницы под руководством Международного консорциума по секвенированию генома пшеницы (IWGSC).

Это важный шаг к получению высококачественной референсной последовательности для каждой из 21 хромосомы пшеницы. Ожидается, что это создаст новое поколение инструментов для селекционеров, ускорит программы по выведению сортов и позволит получить сорта с более высокой урожайностью и улучшенной устойчивостью.

Секвенирование хромосом 6A и 2D будет проводиться в течение следующих двух лет командами:

• Нилса Штайна и Уве Шольца из Института генетики растений и исследований культурных растений им. Лейбница (IPK Gatersleben).
• Клауса Майера из Центра Гельмгольца в Мюнхене.

Исследователи будут использовать технологии высокопроизводительного секвенирования и современные биоинформатические инструменты для сборки генома и точного картирования генов.

Нилс Штайн отметил важность поддержки министерства для долгосрочных исследований в рамках целей IWGSC.

Беат Келлер из Университета Цюриха (Швейцария), член правления IWGSC, высоко оценил решение Германии, подчеркнув её экспертизу в исследованиях генома растений и значимость этого вклада для завершения международного проекта.

Из 21 хромосомы пшеницы в настоящее время высококачественно секвенирована только одна — 3B. Референсное секвенирование ещё 14 хромосом, помимо проекта по 6A и 2D, уже ведётся в 12 странах под руководством IWGSC и будет завершено в ближайшие два года. Для секвенирования оставшихся четырёх хромосом консорциум ищет финансирование. При условии его скорейшего получения, IWGSC ожидает, что высококачественная последовательность генома пшеницы может стать общедоступной к 2019 году.

Контекст и значимость:

• Пшеница — самая распространённая зерновая культура в мире и основной продукт питания для более чем 35% населения Земли, обеспечивая 20% всех потребляемых калорий.
• Для удовлетворения потребностей прогнозируемого населения мира в 9,6 млрд человек к 2050 году урожайность пшеницы должна ежегодно увеличиваться на 1,6%.
• Поскольку ресурсы новых земель, воды и питательных веществ ограничены, этот рост должен быть достигнут в основном за счёт улучшения культур и признаков на уже обрабатываемых землях. Высококачественная референсная последовательность генома внесёт большой вклад в достижение этой цели.