Первое секвенирование генома канадской рыси
Учёные из Массачусетского университета в Амхерсте в сотрудничестве с Vertebrate Genome Laboratory (VGL) в Нью-Йорке публикуют первое полное геномное секвенирование канадской рыси (Lynx canadensis). Этот геном — один из 14, выпускаемых в публичный репозиторий данных для исследований в области эволюции, болезней, генетики и охраны природы, сообщает координатор проекта Таня Лама, докторант по экологии.
Значение для сохранения вида
Как инструмент консервационной генетики, геном предоставляет информацию о генетическом здоровье, демографической и эволюционной истории вида. Он позволяет оценить жизнеспособность популяций с помощью точных данных об их размере, потоке генов и адаптивном генетическом разнообразии в различных ландшафтах. Эта информация критически важна для управления дикой природой и принятия политических решений.
Особый интерес представляет изучение связи между популяцией рыси в штате Мэн и соседними популяциями в Нью-Брансуике и Квебеке, а также их связи с основной популяцией в восточной Канаде через серьёзный барьер — реку Святого Лаврентия.
«Генетика может помочь нам лучше понять динамику популяции рыси в Мэне и останется ли она жизнеспособной в будущем. Если популяции становятся маленькими и изолированными, они более уязвимы к демографическим и экологическим изменениям и подвержены более высокому риску локального вымирания», — отмечает Таня Лама.
Статус вида и будущие задачи
Канадская рысь, внесённая в список находящихся под угрозой исчезновения U.S. Fish and Wildlife Service в 2000 году, обитает в бореальных лесах. Недавно поступило предложение об исключении вида из-под защиты Endangered Species Act.
Если это произойдёт, будет разработана программа мониторинга, и данные о статусе популяции в Мэне и её связи с соседними популяциями станут крайне важны для разработки стратегий сохранения. Даже в случае восстановления популяции потребуется мониторинг и меры по сохранению для отслеживания изменений климата и потери среды обитания.
Связь между популяциями к югу от реки Святого Лаврентия является ключом к их жизнеспособности, а геномные инструменты помогут разработать соответствующие природоохранные меры.
Команда и дальнейшие планы
Над проектом работает команда под руководством Тани Ламы, включающая специалистов из Смитсоновского института, Департамента внутреннего рыболовства и дикой природы Мэна и экспертов по биоинформатике из VGL.
Публикация генома — это не конец работы, а начало многолетнего анализа. Консервационные генетики будут интерпретировать данные, что будет полезно для команд по сохранению вида в других регионах его обитания: Миннесоте, Монтане, Айдахо, Вашингтоне, районе Большого Йеллоустоуна и Колорадо.
«Такой заметный и знаковый вид, как рысь, предоставляет отличную возможность изучить сложные биологические и экологические взаимодействия между видами и природной средой и служит отличной моделью для использования геномных подходов в принятии решений», — говорит генетик Уоррен Джонсон из Смитсоновского института.