Геномные данные коал опубликованы для защиты уязвимого вида

Ученые Группы по геномике дикой природы Австралазии Сиднейского университета загрузили полные геномы 116 коал в открытый доступ, чтобы ускорить важные геномные исследования для поддержки этого угрожаемого вида.

Это произошло всего через три года после публикации первого полного референсного генома коалы, созданного совместными усилиями Сиднейского университета и Австралийского музея.

В ближайшие месяцы 450 геномов будут размещены на серверах, предоставленных Amazon Web Services (AWS), которая активно поддерживает это важное геномное исследование, покрывая расходы на хранение и загрузку большого набора данных в облаке.

Ученые смогут получить доступ к данным через любой веб-браузер и использовать их для исследования ключевых вопросов, касающихся взаимосвязи между генетическим разнообразием коал и болезнями, репродукцией, пищей, которую они едят, и их способностью адаптироваться к изменяющемуся климату.

Со-руководитель программы доктор Кэролин Хогг отметила, что проект создает карту геномного разнообразия коал по всему ареалу. Эта информация поможет обнаружить и защитить популяции, обладающие важными генетическими вариантами, необходимыми для адаптации к меняющейся среде.

Сотрудничество с AWS Open Data Sets позволяет сделать данные публичными сразу после секвенирования образцов, чтобы ускорить исследования этого знакового вида.

Проект получил финансирование в размере 674 000 долларов от правительства штата Новый Южный Уэльс и 348 450 долларов от правительства Австралии. Федеральный министр по охране окружающей среды Сюзан Лей заявила, что программа является частью 18-миллионных инвестиций правительства в инициативы по защите коал.

Коала сталкивается с растущими угрозами из-за вырубки лесов, изменения климата, болезней и ограниченного генетического разнообразия, необходимого для адаптации.

Геномная работа в Сиднейском университете под руководством доктора Кэролин Хогг и профессора Кэти Белов является частью более широкой программы по картированию геномов более 50 угрожаемых видов в рамках Инициативы по угрожаемым видам. В следующем году программа сосредоточится на геномах других видов, включая билби, намбата и вымершего в дикой природе рождественского островного сцинка.