Исследование может привести к созданию защитных пробиотиков для лягушек

Исследователи под руководством Дженнифер Уолк, PhD, из Технологического университета Вирджинии, вырастили бактериальные виды из кожного микробиома четырёх видов амфибий. Работа опубликована 10 июля в журнале Applied and Environmental Microbiology.

В ходе исследования учёные взяли мазки с кожи четырёх видов амфибий, обитающих в Вирджинии. Они культивировали бактерии из мазков и провели их секвенирование. Также было проведено полное секвенирование всех бактерий кожи с помощью технологий следующего поколения (NGS).

Большинство культивируемых бактерий оказались доминантными видами в микробиоме, хотя некоторые редкие виды также удалось вырастить. "Доминантные бактерии, вероятно, выполняют важные функции для хозяина, например, обеспечивают устойчивость к болезням", — сказала Уолк. Некоторые из этих видов, как известно, производят противогрибковые вещества и считаются сильными кандидатами для создания пробиотиков для амфибий.

Исследователям удалось вырастить менее 10% от общего числа видов бактерий кожного микробиома. При этом микробные сообщества у разных видов амфибий были различными.

Исследование важно, поскольку многие амфибии играют критическую роль в экосистемах, контролируя популяции вредных насекомых, включая переносчиков болезней человека, таких как малярия. Полученные знания о роли микробов в устойчивости амфибий к болезням могут быть применены и к другим видам, например, при синдроме белого носа у летучих мышей или грибковых заболеваниях у змей.

Грибок Batrachochytrium dendrobatidis (хитридиомицет) инфицирует почти 300 видов амфибий и, по оценкам, привёл примерно к 100 случаям вымирания. Его распространение во многом обусловлено коммерческой торговлей амфибиями, объём которой составляет 100 млн особей в год. Также появился новый вид хитридиомицета, убивающий саламандр в Европе, что вызывает опасения за разнообразные сообщества саламандр на востоке США.

Из примерно 6000 известных видов амфибий около трети находятся под угрозой или уже вымерли. Среди множества угроз, действующих синергетически, B. dendrobatidis является наибольшей угрозой для амфибий в горных районах.

Польза от этого исследования выходит за рамки сохранения видов. Оно способствует развитию методов культивирования разнообразных бактерий, что важно для борьбы с болезнями в целом, а также для разработки возобновляемой энергии, очистки от загрязнений и лучшего понимания эволюции.