Ученые разработали метод отслеживания репликации вируса желтой лихорадки

Исследователи из Принстонского университета создали новый метод, позволяющий точно отслеживать репликацию вируса желтой лихорадки (YFV) в отдельных иммунных клетках хозяина. Техника описана в статье, опубликованной 14 марта в журнале Nature Communications, и может помочь в разработке новых вакцин против ряда вирусов, включая Денге и Зика.

YFV относится к семейству флавивирусов. Несмотря на широкое применение высокоэффективной вакцины, он ежегодно вызывает до 200 000 случаев заболевания. Вакцина состоит из живой аттенуированной формы вируса YFV-17D, чей RNA-геном более чем на 99% идентичен вирулентному штамму.

Чтобы изучить взаимодействие вирусов с хозяином, группа Александра Плосса адаптировала метод RNA Prime flow, обнаруживающий молекулы RNA в отдельных клетках. С его помощью они отследили реплицирующиеся вирусные частицы в иммунных клетках крови инфицированных мышей.

Мыши обычно устойчивы к YFV, но ученые обнаружили, что даже аттенуированный штамм YFV-17D был летальным, если из иммунных клеток удалить транскрипционный фактор STAT1 (часть противовирусного интерферонового пути). Это говорит о том, что интерфероновый сигналинг защищает мышей от YFV.

YFV-17D эффективно реплицировался в мышах, чья иммунная система была заменена человеческими иммунными клетками. Как и у вакцинированных людей, у этих "гуманизированных" мышей не развивались симптомы болезни, что позволило изучить взаимодействие вируса с человеческим иммунитетом.

С помощью новой техники исследователи установили, что вирус может реплицироваться внутри определенных типов человеческих иммунных клеток, включая B-лимфоциты и естественные киллеры, где его ранее не обнаруживали. Набор клеток-мишеней менялся в ходе инфекции в крови и селезенке, демонстрируя динамику репликации YFV-17D.

Следующий шаг — подтвердить репликацию YFV в этих субпопуляциях иммунных клеток у пациентов и реципиентов вакцины YFV-17D. Метод viral RNA flow теперь позволяет провести такие анализы.

Ученые также планируют выяснить, инфицируют ли вирулентный и аттенуированный штаммы разные иммунные клетки. Этот подход может объяснить, почему одни инфицированные умирают, а у других лишь легкие симптомы, а также какие изменения в геноме YFV-17D ослабляют вирус. «Это может направить рациональный дизайн вакцин против родственных патогенов, таких как вирусы Зика и Денге», — сказал Плосс.