Нидовирусы избыточно экспрессируют гены и кодируют больше белков, чем считалось ранее

Артеривирусы, семейство одноцепочечных РНК-вирусов из порядка Nidovirales, производят больше белков и матричных РНК, чем сообщалось ранее. Это открытие дает важное понимание вируса, который потенциально может эволюционировать для заражения людей в будущем.

Ключевые открытия

  • Используя секвенирование нового поколения, исследователи обнаружили, что вирус Simian hemorrhagic fever virus (SHFV), поражающий обезьян, использует 96 транскрипционных регуляторных последовательностей (TRS) для производства субгеномных мРНК (sg mRNAs). Ранее было известно только о 9 таких последовательностях.
  • Четыре из ранее идентифицированных TRS не являются основными, используемыми для экспрессии генов.
  • Для многих структурных белков вирус использует множество TRS (до 11), и все они активны одновременно, а не являются просто "резервными копиями".
  • Обнаружены TRS в левой части генома, которые продуцируют sg mRNAs, альтернативно усиливающие выработку репликативных белков вируса.
  • Некоторые TRS генерируют sg mRNAs со сдвинутой рамкой считывания, что приводит к синтезу ранее неизвестных белков.
  • Также найдены sg mRNAs, кодирующие только терминальный фрагмент известного вирусного белка. Отключение производства двух таких фрагментов привело к снижению репликации вируса.

Контекст и значение

  • SHFV входит в одну группу с вирусами, вызывающими важные сельскохозяйственные болезни (например, Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) у свиней и Equine arteritis virus (EAV) у лошадей), и родственен вирусу SARS.
  • Инфекция SHFV по-разному влияет на обезьян: у африканских видов часто протекает бессимптомно, а у азиатских макак вызывает острое смертельное геморрагическое заболевание с летальным исходом через 1–2 недели.
  • Вирус поражает макрофаги и дендритные клетки — ключевые компоненты первоначальной защиты организма.
  • Функции вновь обнаруженных вирусных белков пока неизвестны.

Исследование опубликовано в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

2017-10-16