Достигнут рубеж в два миллиона: проект оцифровки NYBG отмечает крупную веху

Нью-Йоркский ботанический сад (NYBG) достиг важной вехи в глобальных усилиях по обеспечению онлайн-доступа к научным коллекциям, добавив двухмиллионный образец растения в свою цифровую исследовательскую коллекцию. Это часть амбициозного проекта по оцифровке всех 7,3 миллионов гербарных образцов в Гербарии Уильяма и Линды Стир — крупнейшем гербарии в Западном полушарии.

Двухмиллионным оцифрованным растением стала саррацения пурпурная (Sarracenia purpurea) — очень редкий местный хищный вид, собранный на особо охраняемой территории в округе Датчесс, штат Нью-Йорк.

Ускорение и значение оцифровки

Оцифровка ведётся при поддержке грантовой программы Национального научного фонда (NSF) «Advancing Digitization of Biological Collections». В настоящее время NSF финансирует шесть проектов в Ботаническом саду, включая четырёхлетний грант на оцифровку 200 000 образцов водорослей и управление порталом данных для 1,1 миллиона оцифрованных образцов водорослей из 48 американских учреждений. Цель NSF — сделать большинство биологических коллекций США доступными онлайн к 2020 году.

«Оцифровка двухмиллионного образца значима не только потому, что мы прошли почти треть пути к цели оцифровать весь Гербарий, но и потому, что теперь мы можем оцифровывать образцы очень быстро», — сказала доктор философии Барбара Тирс, директор Гербария Стир.

Она отметила, что на первый миллион образцов ушло 12 лет, а второй миллион был оцифрован всего за 6 лет. Сейчас сотрудники Гербария оцифровывают 300 000 образцов в год.

Процесс и преимущества оцифровки

Гербарные образцы — незаменимый источник данных для исследований по изменению климата, утрате биоразнообразия, эволюции, сельскохозяйственному развитию и другим актуальным темам.

Процесс оцифровки включает:

1. Фотографирование образца в специальной лаборатории с высоким разрешением.
2. Запись всей информации с этикетки (название вида, дата и место сбора, коллектор) с помощью программного распознавания текста (OCR).
3. Проверку точности данных и их публикацию в поисковой базе данных.

Оцифрованные изображения и данные доступны через C. V. Starr Virtual Herbarium, что избавляет исследователей от необходимости физически посещать гербарий или запрашивать образцы по почте, подвергая хрупкие исторические образцы износу.

Текущие проекты и сотрудничество

NSF в настоящее время поддерживает в NYBG шесть проектов по оцифровке, включая коллекции из Карибского региона (около 300 000 образцов), Бразилии, а также мхов, лишайников, водорослей и макромицетов.

Сад также играет ведущую роль в Global Plants Initiative (при поддержке Фонда Эндрю У. Меллона), целью которой является оцифровка всех известных в мире типовых образцов — эталонных образцов, определяющих вид. На сегодня оцифровано около 140 000 из примерно 150 000 типовых образцов гербария.

Оцифровка саррацении пурпурной выполнена в рамках совместного проекта NSF с участием 34 музеев США по созданию единой базы данных о растениях Северной Америки, насекомых, которые ими питаются, и паразитических ос.

Значение двухмиллионного образца

Саррацения пурпурная — характерное растение болот северо-востока США, одно из первых североамериканских растений, известных европейским поселенцам. Её хищный механизм основан на ловле насекомых в кувшинчики с дождевой водой, где те перевариваются бактериями.

Образец был собран в июне учёными, изучающими сокращение популяций местных видов в долине Гудзона для разработки мер по их сохранению.

«Знания, полученные при изучении ботанических коллекций, помогали направлять и определять приоритеты в охране земель с прошлого до настоящего дня», — сказал Трой Уэлди из The Nature Conservancy. — «Гербарные коллекции — это библиотеки, документирующие окружающий нас природный мир».