Новый инструмент для лечения опасной супербактерии
Исследовательская группа под руководством Университета Саншайн-Кост разработала передовое программное обеспечение, способное одновременно обнаруживать и прогнозировать устойчивость к противомикробным препаратам (УПП) у одной из самых опасных супербактерий — Pseudomonas aeruginosa. Работа опубликована в журнале Genome Medicine.
P. aeruginosa — распространенная бактерия, встречающаяся в воде и почве, способная вызывать у человека инфекции: от наружного отита и воспаления кожи до смертельной пневмонии, сепсиса, легочной недостаточности и заболеваний костей.
Являясь одной из ведущих причин смертности от бактериальных инфекций в мире, этот патоген обладает врожденной устойчивостью ко многим антибиотикам и способностью развивать резистентность к новым препаратам, что затрудняет лечение.
Прорыв в разработке программного обеспечения стал результатом шести лет совместной лабораторной, клинической и биоинформатической работы под руководством сотрудников Центра биоинноваций UniSC доцента Эрин Прайс и доктора Дерека Саровича, а также выпускницы PhD UniSC доктора Даниэль Мадден.
Инновационное ПО использует полногеномное секвенирование ДНК патогена для выявления точных генетических изменений, вызывающих УПП.
Эта новая возможность прогнозировать устойчивость патогена к 10 наиболее клинически важным антибиотикам позволит медицинским работникам раньше и точнее диагностировать инфекции, вызванные устойчивой P. aeruginosa, обеспечивая более быстрые и эффективные варианты лечения.
Доктор Прайс заявила, что это потенциальный переломный момент в помощи врачам при выборе типа антибиотиков для пациентов с инфекцией P. aeruginosa.
«Устойчивость к противомикробным препаратам — это глобальная эпидемия в области здравоохранения, требующая срочных мер, чтобы избежать постантибиотической эры, когда простые инфекции нельзя будет лечить препаратами, которые когда-то произвели революцию в современной медицине. Если не принять меры, к 2050 году от инфекций, вызванных УПП, прогнозируется 10 миллионов смертей в год, а ежегодные затраты превысят $100 триллионов».
Доктор Сарович отметил, что новое программное обеспечение значительно превосходит существующие инструменты обнаружения УПП по точности.
«Оно дает результаты, близкие к текущему "золотому стандарту" тестирования на чувствительность к антимикробным препаратам, который достигается медленным и трудоемким методом. Мы протестировали ПО на австралийских и международных наборах данных штаммов, поэтому оно будет отлично применяться в диагностических, исследовательских лабораториях и лабораториях эпиднадзора за патогенами как здесь, так и за рубежом».
Программное обеспечение уже доступно больницам, имеющим возможность секвенирования генома на месте. В будущем эта технология может стать рутинной и в клиниках общей практики. Его также можно применять в сельском хозяйстве, ветеринарии и экологическом мониторинге, так как патоген вызывает заболевания у растений, лошадей, скота и домашних животных.