Обнаружено более 30 новых видов бактерий в образцах пациентов

Исследователи из Базельского университета и Университетской клиники Базеля с 2014 года собирали и анализировали образцы пациентов, содержащие неизвестные патогены, которые не удавалось идентифицировать стандартными методами. В результате они обнаружили более 30 новых видов бактерий, некоторые из которых имеют клиническое значение. Работа опубликована в журнале BMC Microbiology.

Полный генетический анализ

Команда под руководством микробиолога доктора Даниэля Гольденбергера проанализировала 61 неизвестный бактериальный патоген из образцов крови или тканей пациентов. Поскольку стандартные методы (масс-спектрометрия или секвенирование части генома) не дали результатов, исследователи применили полное секвенирование генома.

Из 61 проанализированной бактерии 35 оказались ранее неизвестными науке. Остальные 26 штаммов были трудноидентифицируемыми — их геномные последовательности были недавно добавлены в базы данных.

Оценка данных пациентов показала, что семь из 35 новых штаммов являются клинически значимыми, то есть могут вызывать бактериальные инфекции у людей.

Причина редких инфекций

Большинство новых видов относятся к родам Corynebacterium и Schaalia (грамположительные палочки). Эти бактерии часто входят в естественный микробиом кожи и слизистых, поэтому их клиническая роль недооценивается, однако они могут вызывать инфекции при попадании в кровоток.

Один из трудноидентифицируемых патогенов, обнаруженный в воспаленном пальце пациента после укуса собаки, также может быть клинически значимым. Канадские исследователи недавно выделили ту же бактерию из ран после укусов собак или кошек и в 2022 году назвали её Vandammella animalimorsus.

Названия и перспективы

Базельские исследователи работают над названиями для новых видов вместе со специалистом по классификации бактерий профессором Питером Вандамме из Гентского университета. Два вида уже названы, например, Pseudoclavibacter triregionum — в честь расположения Базеля у границ Швейцарии, Франции и Германии.

Проект продолжается: уже обнаружено ещё более двадцати новых видов. Технологический прогресс в бактериологии облегчает открытие и описание новых видов, что в будущем позволит точнее диагностировать и эффективнее лечить инфекции, вызванные редкими патогенами.