Расшифрованы секреты ночного попугая: впервые секвенирован его геном

Исследователи из CSIRO, национального научного агентства Австралии, впервые секвенировали геном ночного попугая — одной из самых редких и неуловимых птиц в мире. Это позволит ответить на вопросы о популяционной генетике и биологии вида, что может усилить надежды на его сохранение.

«Геном позволит нам исследовать генетическую основу того, почему ночной попугай ведёт ночной образ жизни — очень необычная черта для попугаев. Мы изучим такие особенности, как навигация, обоняние, форма клюва и его неоптимальное ночное зрение», — сказал доктор Лео Джозеф, директор Австралийской национальной коллекции дикой природы CSIRO.

«Исследователи также смогут провести статистический анализ генома этой особи, чтобы оценить прошлую численность популяций ночного попугая в Австралии. Теперь у нас есть возможность сравнить этот аннотированный геном с геномами других близкородственных попугаев, что прольёт свет на причины его редкости и ограниченного распространения по сравнению со многими родственниками».

Исследователи CSIRO секвенировали геном — генетическую схему — ночного попугая, используя образец ткани, полученный от доктор Кенни Травуйона, исполняющего обязанности куратора орнитологии Западно-Австралийского музея. Образец был получен после того, как коренные жители Пилбары нашли погибшую птицу и передали её в Музей Boola Bardip.

Этот образец, который является наиболее хорошо сохранившимся из выставленных в мире, теперь доступен для публичного просмотра в WA Museum Boola Bardip.

Доктор Гунджун Пандей, руководивший проектом по геномике ночного попугая, отметил, что доступ к технологиям высокопроизводительного секвенирования ДНК в рамках Инициативы CSIRO по прикладной геномике ускоряет геномные исследования в Австралии.

«Теперь мы можем создавать высококачественные геномы из очень маленьких образцов ткани — даже размером с голову муравья или одного комара», — сказал доктор Пандей. «Такой уровень качества и детализации был невозможен даже пять лет назад. Эти генетические данные можно использовать для обеспечения максимального разнообразия в программах сохранения, чтобы вид был устойчивым и имел наилучшие шансы на долгосрочное выживание».

Ночной попугай, когда-то более широко распространённый в засушливых районах Австралии, сократил свою численность из-за изменений окружающей среды, таких как хищничество кошек и лисиц. Теперь он известен только из отдельных частей юго-западного Квинсленда и Западной Австралии.

«Несколько десятков научных образцов были собраны в девятнадцатом веке и один в 1912 году. Затем образец был найден в 1990 году в юго-западном Квинсленде», — сказал доктор Джозеф. «Живые птицы были зарегистрированы в той же области в 2013 году, и, наконец, живой попугай был пойман и помечен в 2015 году».

Хотя геном ночного попугая является ценным научным ресурсом для понимания этой птицы, защита вида от кошек, лисиц, пожаров и потери среды обитания также имеет решающее значение для его сохранения.

«Геном ночного попугая откроет многочисленные возможности для дальнейших исследований, чтобы помочь сохранить этот вид», — сказал доктор Пандей. «Это позволит учёным разработать план спасения ночного попугая, что и является конечной целью секвенирования генома и его публичного распространения».