Микробиом кожи акул устойчив к инфекциям

Исследование микробиома кожи акул стало первым шагом к пониманию удивительной устойчивости их ран к инфекциям.

В дикой природе чернопёрые рифовые акулы часто имеют раны, но редко проявляют явные признаки инфекции вокруг них. Чтобы понять этот феномен, международная команда под руководством исследователей из Центра изучения Красного моря KAUST изучила микробное сообщество, живущее на коже акул.

Команда собрала образцы слизи с кожи со спины и жабр пойманных в дикой природе чернопёрых рифовых акул у Сейшельских островов. Затем они секвенировали ген 16S рРНК для идентификации бактерий и сравнили бактериальные сообщества из разных образцов, чтобы обнаружить изменения в ответ на повреждение.

Анализ не выявил различий между бактериальными сообществами на повреждённой коже жабр и неповреждённых жабрах или спине. То есть не было признаков инфекции вокруг ран. «Мы были удивлены, не обнаружив существенных изменений в бактериальных сообществах кожи», — говорит Клаудия Погореутц, постдок, возглавлявшая исследование.

«Это говорит о том, что кожа акул не так легко инфицируется и что нативное бактериальное сообщество кожи может сохраняться даже после травмы», — добавляет она. «Нам действительно нужно глубже изучить функции бактерий и врождённый иммунитет акул, чтобы понять, что на самом деле происходит и как опосредуется заживление ран».

Однако команда обнаружила различия в бактериальных сообществах, собранных с кожи акул в разных местах. Хотя участки отстояли на несколько километров, они могли быть относительно изолированы друг от друга океанскими течениями и нежеланием акул перемещаться между местами обитания. Различия в микробных сообществах могут отражать различия в окружающей среде (температура, плотность популяции, доступность питательных веществ, загрязнение), но нельзя исключать, что изменения могут давать акулам адаптивное преимущество.

На основе результатов команда определила основной микробиом кожи, который сохраняется у всех чернопёрых рифовых акул, наряду с локальными различиями. Они также не обнаружили изменений в микробиоме вокруг ран, что указывает на отсутствие инфекций или их слабую выраженность.

Остаётся много вопросов: от понимания региональных различий до выяснения того, способствует ли микробиом заживлению ран и устойчивости к инфекциям и как именно. «Всё ещё так много нужно узнать о бактериях, ассоциированных с кожей акул», — говорит Погореутц.

2019-11-04