Ученые определили основное бактериальное сообщество на коже горбатых китов

В статье, опубликованной в журнале с открытым доступом PLOS ONE, исследователи из Океанографического института Вудс-Хоул (WHOI) и их коллеги определили основное сообщество кожных бактерий, общее для популяций горбатых китов. Это может стать способом оценки общего состояния здоровья этих исчезающих морских млекопитающих.

«Кожа — это граница между животным и океаном, в котором оно живет», — сказала ведущий автор Эми Эпприлл, микробиолог WHOI. Изучая бактерии на коже горбатых китов, можно больше узнать об их здоровье и состоянии окружающей среды.

Эпприлл собрала 56 образцов кожи горбатых китов из северной части Атлантического, северной части Тихого и южной части Тихого океанов. Образцы были получены с помощью биопсийных дротиков, а также из кожи, которая естественным образом отслаивается. Подробные популяционные исследования предоставили важные детали о возрасте и поле особей.

Команда секвенировала и идентифицировала более 500 000 генов малой субъединицы рибосомной РНК от бактерий с кожи китов. Данные сравнили с бактериальными последовательностями, обнаруженными на коже погибших китов и китов с травмами и проблемами со здоровьем, например, запутавшихся в рыболовных снастях.

Анализ выявил обилие двух основных групп бактерий, специфичных для горбатых китов — Tenacibaculum и Psychrobacter. Общий состав бактерий различался в зависимости от географического положения, метаболического состояния, а также у ослабленных и погибших особей. У них исследователи обнаружили меньше двух основных бактерий и больше потенциальных патогенов.

«Похоже, всегда существует эта основная группа бактерий, которые прикрепляются к коже кита», — сказал Трейси Минсер, микробиолог WHOI и соавтор исследования. Когда эта группа начинает меняться, появляются другие бактерии — потенциально вредные, такие как анаэробы, обычные для кожных заболеваний человека.

Исследователи пока не уверены, как основные бактерии взаимодействуют с китами или друг с другом. «Следующий шаг — выяснить, что делают основные бактерии — и приносят ли они какую-то пользу китам», — сказала Эпприлл. Они могут, например, очищать кита от обрастающих организмов или производить антибиотики для защиты от патогенов.

«Крупных китов трудно изучать в дикой природе, и оценка их здоровья важна и сложна», — сказал соавтор Джук Роббинс. Это исследование дает первое базовое представление о «нормальном» составе кожных бактерий и является важным шагом к созданию количественного инструмента для оценки здоровья китов и потенциального воздействия деятельности человека.