Почему европейская колонизация привела к исчезновению голубой антилопы
Голубая антилопа (Hippotragus leucophaeus) — африканская антилопа с синевато-серой шкурой, родственная саблерогой и конгони. Последнюю особь застрелили около 1800 года, всего через 34 года после её первого научного описания.
Исследовательской группе, включавшей эволюционных биологов из Потсдама под руководством профессора Михаэля Хофрайтера, удалось получить 40-кратный высокопокрытый геном из образца Шведского музея естественной истории. Это один из всего пяти исторических музейных образцов голубой антилопы, валидированных по ДНК.
Низкое геномное разнообразие и численность популяции часто считаются недостатком, так как могут привести к снижению приспособленности и адаптивности вида. «Однако у голубой антилопы была малая численность популяции на протяжении многих тысячелетий до её вымирания около 1800 года», — поясняет Хофрайтер.
«Тот факт, что не было обнаружено инбридинга и лишь несколько вредных мутаций, указывает на то, что вид был адаптирован к долгосрочно малой численности популяции», — добавляет Элизабет Хемпель, изучавшая антилопу в рамках докторской диссертации в Потсдамском университете и Музее естествознания в Берлине.
Анализ долгосрочной численности популяции также показывает, что на неё не влияли колебания климата ледникового периода. Это неожиданно для крупного травоядного млекопитающего, так как эти циклы должны были приводить к изменениям в доступности среды обитания. Результат предполагает, что текущие модели долгосрочной динамики экосистем в регионе, возможно, нуждаются в уточнении.
Исследователи сделали вывод, что виды могут выживать в течение долгого времени при малой численности популяции, если не подвергаются быстродействующим нарушениям. Следовательно, внезапное антропогенное влияние в ходе европейской колонизации юга Африки в XVII веке, вероятно, сыграло центральную роль в вымирании вида.
В ходе анализа ДНК в геноме также были идентифицированы два гена, которые могут быть ответственны за синий окрас шкуры, которым антилопа обязана своим названием. Это стало возможным с помощью современного программного обеспечения для вычислительного анализа от биотехнологической компании Colossal Bioscience, с которой сотрудничали исследователи.
«В рамках постоянного фокуса Colossal на древней ДНК, взаимосвязях генотипа и фенотипа и восстановлении экосистем мы были рады сотрудничать в новаторской работе профессора Хофрайтера и его команды», — сказал соучредитель и CEO Colossal Bioscience Бен Ламм.
«Цели проекта позволили нашим командам совместно применить некоторые из новейших алгоритмов Colossal для работы с древней ДНК и сравнительной геномики, чтобы понять, что по-настоящему делало голубую антилопу уникальным видом».
Исследование опубликовано в журнале Current Biology.