У кофейных растений есть небольшой, но стабильный корневой микробиом грибов и бактерий

Учёные из Торонто исследовали ткани корней кофейных растений в поисках "основного микробиома" — стабильного сообщества микроорганизмов (бактерий и грибов), формирующего партнёрские отношения с растением.

Понимание этих микробных партнёрств важно для определения лучших практик управления и прогнозирования реакции кофе на меняющиеся условия.

Экологи использовали методы секвенирования нового поколения для образцов с ферм Центральной Америки, которые сильно различались по условиям окружающей среды и системам управления. Они обнаружили 26 видов бактерий и 31 вид грибов, соответствующих их критериям принадлежности к основному микробиому. Некоторые из этих видов известны своими полезными для растений свойствами.

"Бактериальный основной микробиом гораздо сильнее и стабильнее, в то время как грибной микробиом более чувствителен к условиям окружающей среды, которые, как ожидается, расширят свой ареал с изменением климата", — сказала Роберта Фулторп, один из авторов исследования. "Мы также обнаружили, что грибы, по-видимому, связаны с характеристиками корней кофе, а бактерии — нет".

Находка о том, что ряд высокообильных видов микроорганизмов постоянно сохраняется в кофе, является значимой. Как объясняет член команды Адам Мартин:

"То, что одни и те же виды встречаются в огромном диапазоне температур, осадков, условий почвы и доступности света, является новым доказательством существования основного микробиома в реальных условиях".

Результаты открывают путь к пониманию того, можно ли и как управлять микробиомами в реальных сельскохозяйственных системах. Работа также поднимает интересные вопросы о том, влияют ли микробы растения на вкус утренней чашки кофе.