Внешняя среда сильно влияет на грибные сообщества в кишечнике приматов

Исследователи начинают понимать важность кишечных грибов у млекопитающих и то, как различные факторы окружающей среды могут формировать эти грибные сообщества, играющие ключевую роль в регуляции иммунных ответов.

В новом исследовании, опубликованном в npj Biofilms and Microbiomes, представлен обзор состава грибных сообществ кишечника и грибково-бактериальных взаимодействий у разных нечеловекообразных приматов (в неволе и в дикой природе), а также у групп людей с различными способами добычи пищи (традиционные земледельцы, охотники-собиратели и западное население).

Исследовательская группа под руководством вычислительного биолога Ашока Кумара Шармы провела секвенирование генетических маркеров ITS2 и 16S рРНК в образцах фекалий четырех видов нечеловекообразных приматов и трех различных групп людей для профилирования состава грибных и бактериальных сообществ.

Ключевые выводы:

• Сходство между приматами в неволе и людьми, ведущими индустриальный образ жизни, указывает на потенциальное большее влияние диеты и образа жизни, чем генетики, на формирование состава грибного сообщества кишечника и грибково-бактериальных взаимодействий.
• Более высокое сходство грибного состава между людьми, потребляющими неиндустриальную пищу, и дикими человекообразными обезьянами подтверждает эти наблюдения.
• Внешняя среда (экологические, поведенческие и индивидуальные факторы) оказывает сильное влияние на формирование микобиома кишечника приматов — сообществ грибов, колонизирующих желудочно-кишечный тракт.

Основные результаты исследования:

• На состав грибного сообщества в кишечнике примата сильно влияют экологические факторы хозяина, включая диету и образ жизни. Это контрастирует с бактериальной фракцией кишечника, на которую, по-видимому, больше влияет генетика хозяина.
• Экологические различия между популяциями приматов и внутри них влияют не только на грибные сообщества, но и на то, как грибы и бактерии совместно обитают в кишечнике.
• Грибковые и бактериальные таксоны со сходным функциональным потенциалом могут взаимодействовать для выполнения общих метаболических ролей, таких как расщепление широкого спектра углеводов.

Комментарии исследователей:

• Андрес Гомес, PhD: «Эти данные указывают на то, что внешняя среда может иметь очень сильное влияние на формирование сообществ грибов в кишечнике приматов... Возможно, более интересный вопрос должен быть сосредоточен на том, влияет ли отсутствие грибкового разнообразия в западных/индустриальных популяциях людей на здоровье».
• Клара Юдита Петржелкова, PhD: «Поскольку экологические факторы, вероятно, играют более важную роль, чем генетика хозяина, в формировании микобиома, мы можем предположить, что микобиом может быть лучшим индикатором здоровой и стабильной экосистемы, в которой живут приматы».

В будущем значительным шагом вперед станет измерение вклада конкретных источников пищи для определения механизмов формирования грибковых сообществ в желудочно-кишечном тракте.