Разнообразие сельских популяций Африки распространяется и на их микробиомы
Новое исследование, опубликованное в журнале Genome Biology, значительно продвинулось в изучении различий микробиомов кишечника у людей из неиндустриальных обществ. Работа под руководством генетиков из Пенсильванского университета (США) в сотрудничестве с учёными из Танзании, Ботсваны и Национальных институтов здоровья (NIH) стала одним из крупнейших на сегодняшний день анализов микробиомов этнически разнообразных африканцев.
Масштаб исследования
- Проанализированы образцы 114 человек из Ботсваны и Танзании, представляющих семь популяций с разным образом жизни: от агропасторалистов и пасторалистов до охотников-собирателей.
- Для сравнения использовались образцы из США.
Ключевые выводы
- Широкий спектр профилей микробиома между популяциями сравним по масштабу с различиями между индустриальными и неиндустриальными обществами.
- Неожиданное сходство: микробиомы части ботсванских агропасторалистов, говорящих на языках банту, оказались почти неотличимы от микробиомов жителей Филадельфии (США). Это опровергло первоначальную гипотезу о том, что диета является главным фактором различий.
- Общие закономерности:
- Образцы из Танзании имели большее количество микробных видов в каждом образце, и профили микробиомов у отдельных людей были более схожи.
- В Ботсване и США в образцах было меньше микробных видов в целом, а индивидуальные микробиомы сильнее отличались друг от друга.
- Учёные предполагают, что причина может быть связана с относительно высоким уровнем благосостояния Ботсваны и доступом к медицинской помощи (включая антибиотики), что является "мягкими мерами" индустриализации.
Другие важные различия
- Охотники-собиратели (сан и хадза) имели иные паттерны кишечных бактерий по сравнению с пасторалистами или агропасторалистами.
- В популяциях масаи и хадза, где разделение труда между мужчинами и женщинами особенно выражено, обнаружены значительные половые различия в микробиомах.
Функциональный анализ микробных путей
- В образцах из США выявлены пути, участвующие в расщеплении загрязнителей окружающей среды, таких как бисфенол А (BPA) и инсектицид ДДТ.
- Пути расщепления ДДТ также обнаружены в образцах из Ботсваны, где это химическое вещество до сих пор используется для борьбы с малярийными комарами.
Перспективы
Исследователи отмечают, что даже эти удалённые африканские популяции не статичны в своих практиках. Развитие и его влияние на окружающую среду и традиционный образ жизни могут проявляться в изменяющихся паттернах микробиома. Учёные планируют дальнейшие анализы, включая поиск желудочно-кишечных патогенов и проведение лонгитюдных исследований для отслеживания изменений микробиома по мере трансформации образа жизни.