ДНК яиц паразитов из древних уборных раскрывает детали питания прошлого

Анализ ДНК из яиц паразитов, обнаруженных в древних уборных, даёт новые подсказки о пищевых привычках, одомашнивании животных и охотничьих практиках прошлых популяций. Исследование опубликовано 25 апреля 2018 года в журнале PLOS ONE.

Кишечные паразитические черви откладывают яйца, которые выводятся с фекалиями. Они могут передаваться от человека к человеку или через промежуточных животных-хозяев (например, свиней или рыб) при употреблении мяса или через загрязнённую почву.

Новый подход к анализу

В отличие от предыдущих исследований, использовавших микроскопию, авторы применили метод shotgun sequencing (метагеномное секвенирование). Сначала они отфильтровали и сконцентрировали яйца паразитов из образцов древних уборных Бахрейна, Иордании, Дании, Нидерландов и Литвы, охватывающих период с 500 г. до н.э. по 1700 г. н.э. Это обеспечило достаточное количество ДНК для анализа.

Результаты исследования

  • Большая часть ДНК принадлежала паразитам, передающимся от человека к человеку, но значительная часть — паразитам, передающимся через сырую или плохо приготовленную рыбу и свинину.
  • ДНК яиц также указала на животных, живших рядом с людьми: овцы, лошади, собаки, свиньи и крысы.
  • Дополнительный анализ животной и растительной ДНК в образцах показал:
    • Животная ДНК: отражает практики одомашнивания, охоты и рыболовства. В датских образцах (1018–1400 гг. н.э.) обнаружена ДНК финвала, косули и зайца.
    • Растительная ДНК: отражает региональные диеты, включая обилие капусты и гречихи в Северной Европе.

Дополнительные возможности метода

Метод также позволил полностью восстановить митохондриальные геномы нескольких древних паразитов. Это открывает перспективы для изучения эволюционных связей и распространения паразитов в будущих исследованиях.

«Древняя ДНК из уборных позволила идентифицировать останки широкого спектра человеческих и животных паразитов, а также животных и растений, — говорит Мартин Сё. — Это даёт новые и уникальные представления о паразитизме, диете и способах жизнеобеспечения прошлых популяций».

2018-04-25