CRISPR EvolvR: Новая платформа для направленной эволюции генов

Ученые из Инновационного института геномики (IGI) представили новую технологию EvolvR — систему на основе CRISPR для направленной эволюции конкретных генов внутри живых клеток. Платформа позволяет создавать случайные мутации в заданном участке ДНК, чтобы находить полезные варианты генов, которых нет в природе.

Как работает EvolvR

Система построена на программируемом белке Cas9, который «привязан» к ферменту ДНК-полимеразе.

  1. Специальная «надрезающая» версия Cas9 находит целевой ген и делает разрыв (ник) только в одной цепи ДНК.
  2. ДНК-полимераза начинает ремонтировать разрыв, но при этом совершает ошибки («опечатки»), создавая случайные мутации в последовательности.
  3. Этот процесс можно повторять многократно, генерируя миллионы вариантов гена и отбирая те, которые дают желаемый признак.

Ключевые преимущества

  • Точность: Мутации создаются только в целевом гене, а не во всем геноме.
  • Безопасность для клеток: Не требует создания двухцепочечных разрывов ДНК, которые токсичны для многих организмов.
  • Универсальность: Не зависит от сложных клеточных систем репарации, поэтому должна работать в любых видах, включая бактерии, растения и человеческие клетки.
  • Непрерывность: Позволяет вести непрерывный процесс эволюции и обогащения полезных признаков, имитируя естественный ход эволюции.

Будущее технологии

Исследователи видят огромный потенциал для EvolvR:

  • Создание дрожжей для эффективного производства биотоплива из отходов.
  • Ускоренная разработка новых биомолекул для терапии человека (лекарства, системы доставки препаратов).
  • Комбинация с высокопроизводительным CRISPR-скринингом для одновременной эволюции тысяч генов.

«EvolvR обладает огромным потенциалом как не зависящий от вида инструмент для направленной эволюции», — отмечает соавтор работы Дэвид Шаффер.

Исследование «CRISPR-guided DNA polymerases enable diversification of all nucleotides in a tunable window» опубликовано в журнале Nature.

2018-08-02