Раскрывая секреты бактериальных биоплёнок — чтобы использовать их против них

Биоплёнки — это сообщества плотно упакованных бактерий, растущих в тесной связи с поверхностями, такими как песок и почва. Эти сообщества имеют микроскопические башнеподобные структуры, пересечённые водными каналами, всё это заключено в защитный, производимый самими бактериями слизистый слой. Бактерии внутри общаются и демонстрируют кооперативное поведение, напоминающее примитивные органы.

Биоплёнки повсюду вокруг нас

Биоплёнки могут быть размером от менее дюйма до нескольких сотен футов. Они встречаются повсюду в природе: как строматолиты, тина в прудах или скользкий слой на камнях в ручьях. Они также образуются на искусственных материалах: корпусах судов, градирнях, очистных сооружениях, нефтеперерабатывающих заводах, в системах водоснабжения, вызывая биозагрязнение и коррозию.

До 90% бактерий предпочитают жить в поверхностно-ассоциированных сообществах биоплёнок, а не как свободно плавающие (планктонные) клетки. Объединение даёт силу: биоплёнки помогают бактериям удерживаться в благоприятных местах, лучше противостоять дефициту питательных веществ, стрессу, высыханию и хищничеству, а также способствуют кооперации и обмену генетическим материалом.

Биоплёнки вредят здоровью человека

Биоплёнки связаны с:

  • Контаминацией контактных линз и язвами роговицы.
  • Зубным налётом, ведущим к кариесу и пародонтиту.
  • Инфицированием хирургических ран, мочевыводящих путей, хронических и ожоговых ран, лёгких пациентов с муковисцидозом.
  • Колонизацией медицинских устройств: катетеров, протезов суставов, сердечных клапанов.

Согласно Национальным институтам здоровья (NIH), более 65% хронических воспалительных и инфекционных заболеваний вызваны биоплёнками. По последним исследованиям, инфекции, связанные с биоплёнками, уносят столько же жизней, сколько инфаркт или рак. Их лечение обходится в миллиарды долларов ежегодно во всём мире.

Проблема лечения: устойчивость биоплёнок

Когда бактерии прикрепляются к поверхности и растут как биоплёнки, они меняются (меняется экспрессия генов и производимые белки). Одно из следствий — биоплёночные бактерии становятся менее восприимчивы к биоцидам, дезинфектантам и антибиотикам.

Причины снижения восприимчивости:

  1. Слизистый слой затрудняет физический доступ антимикробных агентов к бактериям.
  2. Бактерии в биоплёнках растут медленно и испытывают высокий уровень стресса, что делает большинство антибиотиков неэффективными (они работают на активно растущих клетках).
  3. Изменение поведения и набора активных генов делает бактерии более устойчивыми.

Бактерии, растущие в биоплёнке, могут быть в 1000 раз более устойчивы к антибиотикам, чем те же бактерии, выращенные планктонно. Эта толерантность — отличительная черта биоплёнок — лежит в основе многих персистирующих инфекций.

Новые направления атаки на биоплёнки

Перспективное новое направление — манипуляция образом жизни биоплёнки. Для бактерий это выбор образа жизни, который включает:

  1. Прикрепление нескольких планктонных бактерий к поверхности.
  2. Рост в сложные трёхмерные структуры.
  3. Побег при истощении ресурсов или перенаселении.

Исследования сосредоточены на двух крайностях: предотвращении прикрепления и индукции побега.

Контроль прикрепления:

  • Разработка новых материалов для медицинских устройств с нелипкой, отталкивающей или токсичной поверхностью (покрытия с коллоидным серебром, антибиотиками, микрощётками).
  • Поиск химических соединений, предотвращающих прикрепление.

Манипуляция образом жизни:

  • "Глушение" бактериального языка: Бактерии координируют образование биоплёнок с помощью химических сигналов (у разных видов, например, E. coli или S. aureus, эти молекулы различаются). Блокировка этой коммуникации или ключевых белков координации успешно нарушает образование биоплёнок в лабораторных условиях и некоторых клинических пилотных исследованиях.
  • Перехват бактериального языка: Можно заставить бактерии получить сигнал "покинуть биоплёнку!", что заставляет их отказаться от защитного образа жизни и снова стать планктонными клетками, которые более восприимчивы к антибиотикам.

Будущий контроль над биоплёнками, вероятно, потребует комбинации стратегий, направленных как на прикрепление, так и на побег, с использованием антибиотиков, блокаторов коммуникации и, вероятно, в определённой степени адаптированных к разным бактериальным образам жизни.