B10K — Расшифровка геномов всех птиц
Консорциум Avian Phylogenomics официально объявляет о запуске проекта Bird 10,000 genomes (B10K) — инициативы по созданию репрезентативных черновых последовательностей геномов всех ныне живущих видов птиц в течение следующих пяти лет. Это будет первая попытка секвенировать геномы всех живых видов целого класса позвоночных. Создание проекта основано на успехе предыдущего проекта на уровне отрядов, который предоставил первое доказательство концепции для масштабного секвенирования множества репрезентативных видов в пределах класса позвоночных и показал, какие открытия возможны с такими геномами (1).
Объявление о проекте B10K опубликовано сегодня в журнале Nature.
Птицы, насчитывающие около 10 500 живых видов, представляют собой самый богатый видами класс наземных позвоночных. Они широко используются как модели для исследований в популяционной генетике, нейробиологии, биологии развития и охране природы. Изучение птиц исторически привело к многочисленным пионерским открытиям в биологии.
За последнее десятилетие технологии секвенирования геномов стремительно развивались. Недавно проект на уровне отрядов, возглавляемый исследователями из BGI, Копенгагенского университета и Университета Дьюка (2), секвенировал и собрал геномы 48 видов птиц, представляющих почти все отряды. Консорциуму удалось разрешить большую часть спорных вопросов филогенетической истории современных птичьих отрядов (4).
Учитывая относительно небольшой размер и менее сложные особенности птичьих геномов по сравнению с другими позвоночными, прогресс в технологиях секвенирования и обширную доступность высококачественных образцов тканей птиц в музеях мира, достижение этой амбициозной цели не только возможно, но и практично.
Проект B10K позволит:
- Завершить построение геномного древа жизни всего класса птиц.
- Расшифровать связь между генетической вариацией и фенотипической изменчивостью.
- Раскрыть корреляцию генетической эволюции с биогеографическими паттернами и биоразнообразием.
- Оценить влияние различных экологических факторов и деятельности человека на эволюцию видов.
- Выявить демографическую историю целого класса организмов.
Консорциум будет выполнять проект в три этапа, каждый из которых фокусируется на достижении вех на иерархических уровнях классификации птиц. Ожидается, что проект окажет значительное научное и общественное влияние, изменит понимание биологии и эволюции птиц и откроет двери для новых областей исследований.