Древний геном из Южной Африки проливает свет на происхождение человека

Анализ ДНК скелета мужчины, жившего 2330 лет назад на южной оконечности Африки, дает важные подсказки о происхождении человека. Его генетический профиль оказался одним из самых "ранне-дивергировавших" — старейших в генетическом плане — обнаруженных в регионе, где, как считается, примерно 200 000 лет назад появились современные люди.

Морской собиратель из Сент-Хелены

Скелет был обнаружен археологом профессором Эндрю Смитом в бухте Сент-Хелена в 2010 году. Исследование биологического антрополога профессора Алана Морриса показало, что это был мужчина ростом 1,5 метра, "морской собиратель". Костный нарост в слуховом канале ("ухо серфера") указывал на частое ныряние в холодной воде за пищей. Раковины, найденные рядом и датированные тем же периодом, подтвердили его рацион. По остеоартриту и износу зубов его возраст определили как около 50 лет.

Сложная работа с древней ДНК

Из-за высокой кислотности почв в регионе извлечение ДНК из скелетов было проблематичным. Команда профессора Ванессы Хейс сотрудничала с ведущей лабораторией палеогенетики профессора Сванте Паабо в Институте эволюционной антропологии Макса Планка (Лейпциг), которая успешно секвенировала геном неандертальца.

Из зуба и ребра был извлечен генетический материал и сгенерирован полный митохондриальный геном. Митохондриальная ДНК (мтДНК) — это ДНК, передающаяся по материнской линии, которая помогла доказать африканское происхождение всех людей и построить "генетическое древо", все ветви которого происходят от общей "Митохондриальной Евы".

Ключевые результаты и значение

Исследование, опубликованное в журнале Genome Biology and Evolution, показало, что этот мужчина, принадлежавший к ныне предположительно вымершей линии, и другие коренные жители побережья были наиболее тесно связаны с "Митохондриальной Евой".

• Отличие от других групп: Этот морской охотник-собиратель генетически отличался от современных ему охотников-собирателей пустыни Калахари.
• До миграции: Он жил до миграции в регион около 2000 лет назад, когда скотоводы с отарами овец пришли с севера, из Анголы. Его мтДНК несла уникальный вариант, не встречавшийся у этих мигрантов.
• Базовый уровень: Теперь этот геном служит базой для сравнения с геномами более поздних скотоводов.

Будущее геномных исследований

Профессор Хейс подчеркивает важность подобных находок для создания более точной референсной (эталонной) последовательности генома человека.

"Когда кого-то секвенируют, его геном не собирают с нуля. Вместо этого участки секвенированного генома сопоставляются с референсным геномом. Текущий референсный геном сильно смещен в сторону европейского вклада и плохо репрезентирует коренные народы мира", — говорит она.

"Чтобы получить хороший референс, нужно вернуться к истокам человечества. В этом исследовании, возможно, мы нашли индивидуума из линии, которая отделилась очень рано в эволюции современного человека и оставалась географически изолированной. Это может значительно помочь в уточнении референсного генома человека".