ДНК возрастом в века помогла определить происхождение скелетов рабов, найденных на Карибах
Более 300 лет назад три африканских раба умерли на карибском острове Сен-Мартен. Их судьба не была задокументирована, а имена и точное этническое происхождение оставались неизвестными. Веками их скелеты подвергались воздействию жаркого влажного климата, пока не были обнаружены в 2010 году во время строительных работ в районе Зутстег столицы Филипсбурга.
Исследователи из Стэнфордского университета и Копенгагенского университета извлекли и секвенировали крошечные фрагменты ДНК, сохранившиеся в зубах скелетов. На основе этих данных они смогли определить, где в Африке эти люди, вероятно, жили до того, как были захвачены и обращены в рабство.
Это исследование стало первым случаем, когда ученые смогли использовать столь древнюю, плохо сохранившуюся ДНК для точной идентификации этнического происхождения давно умерших людей. Результаты открывают путь к лучшему пониманию схем трансатлантической работорговли и могут изменить общую практику генеалогических и исторических исследований.
Новый инструмент
Исследователи использовали недавно разработанную в лаборатории Бустаманте технику захвата всего генома (whole-genome capture), чтобы выделить достаточно древней ДНК из скелетов для секвенирования и анализа. Они выяснили, что один скелет принадлежал мужчине, который, вероятно, относился к бантуязычной группе в северном Камеруне. Два других показали сходство с небантуязычными группами на территории современных Нигерии и Ганы.
Получение ДНК из корней зубов
ДНК была изолирована из корней зубов каждого скелета. Несмотря на относительную защищенность корней от внешней среды, ДНК была очень плохо сохранена и сильно фрагментирована из-за столетий воздействия жарких и влажных условий. Первоначальное секвенирование дало лишь короткие участки сильно поврежденной ДНК.
Метод захвата всего генома позволил «выловить» фрагменты древней ДНК из смеси. Этот подход похож на использование мощного магнита для извлечения металла из почвы. Он позволил сконцентрировать древнюю ДНК для более эффективного секвенирования.
Затем с помощью анализа главных компонент (principal component analysis) последовательности ДНК порабощенных африканцев сравнили с референсной панелью из 11 западноафриканских популяций, чтобы определить конкретные этнические группы, от которых, вероятно, произошел каждый индивид.
«Мы смогли определить, что, несмотря на то, что три человека были найдены на одном месте и, возможно, прибыли на одном корабле, они имели генетическое сходство с разными популяциями внутри Африки», — сказала Мария Авила-Аркос. «Они могли говорить на разных языках, что затрудняло общение. Это заставляет нас задуматься о двух вещах: о динамике трансатлантической работорговли внутри Африки и о том, как это драматическое этническое смешение могло повлиять на сообщества и идентичность в Америках».