Новый диагностический инструмент для глобальной угрозы Xylella fastidiosa повышает специфичность

Бактерия Xylella fastidiosa отличается широким кругом растений-хозяев, способностью заражать более 300 видов растений. Она давно наносит серьёзный ущерб сельскохозяйственным культурам и деревьям в Северной и Южной Америке, особенно винограду и цитрусовым.

В 2013 году X. fastidiosa впервые была обнаружена за пределами Америки, поражая оливковые деревья на юге Италии и вызывая синдром быстрого увядания оливы. С тех пор её всё чаще находят в различных регионах Франции и Испании на множестве видов растений, что делает разработку быстрых и надёжных диагностических инструментов критически важной для эффективных стратегий борьбы с болезнью.

В исследовании, опубликованном в журнале Plant Disease, Bonants et al. сообщают об успешном повышении надёжности существующих диагностических инструментов для X. fastidiosa. Команда объединила два существующих метода с внутренним контролем, разработав триплексный TaqMan-анализ. Его использовали для анализа экстрактов ДНК из естественно и искусственно заражённого растительного материала, а также из здорового материала.

Новый анализ обладает повышенной специфичностью, так как нацелен на два локуса в геноме X. fastidiosa, а не на один. Это первый успешно разработанный диагностический инструмент такого типа для данного патогена.

Кроме того, исследователи разработали процедуры анализа экстрактов ДНК из заражённых и здоровых растений с помощью технологии секвенирования нового поколения (NGS). Это первый случай, когда экстракты из растений, заражённых X. fastidiosa, были проанализированы таким образом. Во всех образцах были обнаружены последовательности ДНК, специфичные для X. fastidiosa, а в большинстве случаев патоген удалось идентифицировать до уровня подвида. Эта новая процедура прокладывает путь для будущих исследований по отслеживанию и трассировке распространения бактерии.