Новая технология позволяет быстро секвенировать полные геномы фитопатогенов

Технологии секвенирования нового поколения значительно упростили быструю диагностику болезней растений. По словам фитопатолога Ясмин Риверы из программы по защите и карантину растений Министерства сельского хозяйства США (USDA), новая технология облегчает секвенирование целых геномов за очень короткое время.

Исследователи провели объективную оценку технологии и протоколов Oxford Nanopore Technologies для длинного чтения. Они использовали протоколы компании для подготовки библиотек РНК и ДНК из заражённого вирусом растительного материала и из фитопатогенной бактерии соответственно.

Результаты: Уже через час секвенирования данных учёные получили достаточно информации для сборки небольших геномов.

Исследование, опубликованное в журнале Plant Health Progress, представляет прямое сравнение протоколов. Это позволяет специалистам определить, какой набор для подготовки библиотек лучше всего подходит для их задач.

Быстрое получение полного генома организма имеет большое значение для фитопатологии. Наличие большего объёма информации облегчает идентификацию новых и трудноопределяемых патогенов.