Учёные раскрыли разнообразие вироидов и вироидоподобных агентов

Исследователи из Национальной медицинской библиотеки (NLM) и ряда академических институтов разработали вычислительный конвейер для идентификации и лучшего понимания вироидов и вироидоподобных ковалентно замкнутых кольцевых РНК (cccRNAs). Результаты опубликованы в журнале Cell.

Вироиды — это кольцевые РНК длиной всего 250–400 нуклеотидов, самые маленькие и простые из известных инфекционных агентов. Считалось, что они вызывают инфекции только у растений. Их разнообразие было плохо изучено.

Проанализировав 5131 метатранскриптом и 1344 растительных транскриптома на наличие вироидоподобных cccRNAs, учёные обнаружили 11 378 таких молекул, относящихся к 4409 видовым кластерам. Это в пять раз больше, чем было известно ранее.

Оказалось, что этот класс патогенов не ограничен несколькими растениями, как считалось, а широко распространён в самых разных средах и организмах, сопоставимо с известными РНК-вирусами. Также были обнаружены дальние родственники вируса гепатита дельта человека, что проливает свет на происхождение этого важного патогена, а также совершенно новые типы вирусов.

«Эта работа открывает новые направления для исследователей по всему миру», — сказал соавтор исследования Юджин В. Кунин, старший научный сотрудник NLM.