Не существует «мусорной РНК», заявляют исследователи из Питтсбурга
Короткие цепочки РНК, ранее считавшиеся клеточным мусором, на самом деле являются очень стабильными молекулами, которые могут играть важную роль в клеточных процессах. К такому выводу пришли учёные из Медицинской школы Университета Питтсбурга и Онкологического института UPCI.
Результаты, опубликованные в онлайн-версии Journal of Virology, представляют собой первое исследование очень маленьких продуктов РНК, названных необычно малыми РНК (usRNAs). Дальнейшее изучение этих usRNAs, которых существуют тысячи, но до сих пор ими пренебрегали, может привести к созданию новых типов биомаркеров для диагностики и прогноза, а также новых мишеней для терапии.
Старший автор работы Бино Джон, доктор философии, отметил, что в последние годы учёные признали важность малых РНК, которые обычно содержат более 20 молекулярных единиц — нуклеотидов.
«Но до наших экспериментов мы не осознавали, что РНК длиной всего в 15 нуклеотидов, которые мы считали просто клеточными отходами, удивительно стабильны и многократно, воспроизводимо и точно производятся в разных типах тканей», — сказал доктор Джон. «Мы назвали их usRNAs и идентифицировали тысячи таких молекул, разнообразие которых намного превышает все другие, более длинные РНК, найденные в нашем исследовании».
Эксперименты команды начались с наблюдения, что герпесвирус, ассоциированный с саркомой Капоши, производит usRNA, способную контролировать выработку человеческого белка. Детальные исследования с использованием как вычислительных, так и экспериментальных инструментов выявили удивительно большой мир usRNAs длиной примерно в 15 нуклеотидов с интригующими характеристиками.
Многие usRNAs взаимодействуют с белками, уже известными своим участием в регуляторных путях малых РНК. Некоторые также имеют высокоспецифичные нуклеотидные последовательности на одном из концов. Исследователи отметили, что существование нескольких различных паттернов в usRNAs отражает разнообразие путей, в которых эти РНК участвуют.
«Эти данные позволяют предположить, что usRNAs вовлечены в биологические процессы, и мы должны исследовать их дальше», — подчеркнул доктор Джон. «Они могут стать ценными инструментами для диагностики заболеваний или, возможно, представят новые мишени для лекарств».
Помимо изучения потенциала в качестве биомаркеров, он и его коллеги планируют лучше охарактеризовать различные подклассы usRNAs, идентифицировать их белковые партнёры и изучить, как они производятся в клетке.