Вирусы-«безбилетники» в геноме одноклеточных организмов

Исследователи из Университета Инсбрука обнаружили в геномах сложных одноклеточных эукариот ДНК более 30 000 ранее неизвестных вирусов. В некоторых случаях до 10% ДНК микроба состояло из этих «скрытых» вирусов.

Вирусы как защитники

Вирусы не причиняют вреда своим хозяевам. Напротив, они, вероятно, похожи на вирофаги — вирусы, которые заражают и уничтожают другие, вредоносные вирусы (например, «гигантские вирусы»), атакующие клетку-хозяина. Это может защищать популяцию клеток от уничтожения.

Источник открытия

Исследование началось с изучения новой группы вирусов, обнаруженных в 2021 году в воде альпийского озера Госсенкёллезе. Для масштабного анализа всех известных последовательностей ДНК микробов использовались:

• Высокопроизводительный компьютерный кластер «Leo».
• Технология Oxford Nanopore для секвенирования ДНК.

Анализ огромного массива данных (сотни гигабайт) выявил не только искомые вирусы, но и привел к неожиданному открытию тысяч новых.

Исследование опубликовано в Proceedings of the National Academy of Sciences и проведено совместно с Институтом медицинских исследований Макса Планка и Университетом Гронингена.