Проект по секвенированию раскроет биотехнологический потенциал одноклеточных водорослей

Международная сеть ученых запустила амбициозный план по секвенированию геномов всех известных видов эвгленоидов в течение следующего десятилетия. Инициаторы считают, что это может привести к прорывам в создании новых биотоплив, устойчивых продуктов питания и лекарств от рака.

Euglena International Network (EIN) — глобальный консорциум, основанный в 2020 году, объединяет сотни ученых для поддержки исследований эвгленоидов через совместную работу в области омиксных технологий.

Сеть опубликовала позиционную статью в Biology Open, обосновывающую необходимость скоординированных усилий по созданию высококачественных референсных геномов для почти 1000 известных видов эвгленоидов.

Эвгленоиды — это протисты, эукариотические организмы, не относящиеся к животным, растениям или грибам. Эти разнообразные одноклеточные организмы обитают в чрезвычайно широком диапазоне экосистем по всему миру.

Многие виды эвгленоидов имеют практическое применение, демонстрируя большой потенциал в производстве:

  • Биотоплива

  • Нутрицевтиков

  • Биоремедиации

  • Противораковых средств

  • Моделей для робототехники

Их огромный потенциал в значительной степени не раскрыт из-за отсутствия высококачественных референсных геномов.

Геномы эвгленоидов представляют особую сложность для секвенирования, так как являются примером вторичного эндосимбиоза — они содержат митохондрии, хлоропласты и остатки генетического материала от организмов, которые они поглотили для приобретения этих органелл.

В результате, менее 20 видов были исследованы на предмет трансляционного потенциала с помощью геномики.

Цели проекта EIN:

  • Понять базовую биологию эвгленоидов.
  • Изучить их эволюцию.
  • Максимизировать их применение в экологическом и природоохранном управлении.
  • Исследовать, адаптировать и коммерциализировать продукты на основе эвгленоидов.

Собранные данные будут открыто доступны научному сообществу через European Nucleotide Archive (ENA), а затем могут быть импортированы в такие ресурсы, как Ensembl Protists.

Как отмечает д-р ТанкГод Эчезона Эбенезер, основатель и президент EIN, биоинформатик из EMBL-EBI (Великобритания): "Сеть сыграет решающую роль в объединении специалистов... Это может быть полезно для дальнейшего понимания эволюции паразитизма, разработки реактивного топлива или поддержки исследования космоса человеком".

2022-11-22