Маленькая РНК играет ключевую роль в колонизации кишечника
Исследовательская группа под руководством профессора Тилля Штроувига из Центра исследования инфекций имени Гельмгольца (HZI) изучила механизмы адаптации и распространения широко распространенной, но малоизученной кишечной бактерии Segatella copri.
Распространенность Segatella copri
Segatella copri является ключевым микроорганизмом в одном из трех энтеротипов (основных паттернов колонизации кишечника). Бактерия широко распространена в развивающихся странах и специализируется на расщеплении пищевых волокон. Однако её роль для здоровья человека (полезная или вредная) оставалась неясной.
Открытие ключевой малой РНК
Изучая транскриптом Segatella copri (совокупность всех молекул РНК в клетке), ученые обнаружили маленький фрагмент РНК, играющий важную роль в размножении и распространении бактерии. Его назвали SrcF (Segatella RNA colonization factor).
Исследования на мышах с определенным микробиомом показали, что SrcF выступает в качестве важного контрольного элемента при колонизации бактерией новых участков кишечника.
Факторы, влияющие на активность SrcF
- Активация: Выработка SrcF запускается наличием определенных сложных углеводов (пищевых волокон), которые служат источником энергии для бактерии.
- Подавление: Высокая концентрация фруктанов (полисахаридов на основе фруктозы) подавляет активность SrcF.
Влияние микробиома и коммуникация бактерий
Состав кишечного микробиома также влияет на активацию сигнального пути через SrcF. Различные виды бактерий конкурируют за ресурсы и общаются друг с другом, что поддерживает баланс экосистемы.
«Согласно нашим результатам, расщепление большого количества фруктанов, по-видимому, влияет на коммуникацию между разными кишечными бактериями», — говорит Тилль Штроувиг.
Исследование, опубликованное в журнале Cell Host & Microbe, углубляет понимание механизмов колонизации кишечника и может в перспективе способствовать разработке подходов для целенаправленного влияния на микробиом в интересах здоровья человека.