Новый метод с портативным секвенатором ДНК позволяет выявлять болезни пшеницы на ранней стадии

Традиционная диагностика болезней сельскохозяйственных культур, основанная на визуальной оценке симптомов экспертами-патологами, имеет серьёзные ограничения. Она не позволяет быстро идентифицировать неизвестные патогены во время вспышек, что было продемонстрировано на примере опустошительного вторжения южноамериканских рас грибка Magnaporthe oryzae (возбудителя пшеничного бласта) в Бангладеш.

Группа учёных из Австралии разработала новый метод анализа ДНК патогенов в образцах листьев пшеницы с использованием портативного секвенатора ДНК. Этот подход позволил:

• Осуществить раннее выявление болезней.
• Провести широкий спектр детекции патогенов.
• Охарактеризовать все организмы (микробиом) в образце пшеницы, подтвердив присутствие заболеваний, которые ранее не были диагностированы патологами.

По словам исследователей, "комбинация методов секвенирования на месте и в централизованных лабораториях в будущем революционизирует управление биобезопасностью в сельском хозяйстве и сократит потери урожая". Эти методы могут быть интегрированы в рутинный полевой мониторинг и проверку биобезопасности на национальных границах, что сэкономит время и средства и предотвратит разрушительные вспышки.

Исследование также показывает, как новая стратегия может идентифицировать микроорганизмы, подавляющие болезни, для использования в экологически безопасных методах контроля. Статья "Pathogen Detection and Microbiome Analysis of Infected Wheat Using a Portable DNA Sequencer" была опубликована онлайн в мае 2019 года перед окончательной публикацией в июньском номере полностью открытого журнала Phytobiomes Journal.