Универсальный мультигенный маркер может произвести революцию в исследованиях биоразнообразия

Международная команда под руководством ученых из Музея Кёнига в Бонне (Институт анализа изменений биоразнообразия имени Лейбница) впервые успешно протестировала универсальный набор генов для систематической характеристики различных видов животных. Их работа опубликована в Methods in Ecology and Evolution.

Многие из используемых до сих пор методов молекулярной регистрации биоразнообразия часто оказываются ошибочными, поскольку используют лишь один генетический маркер, который не всегда правильно отражает видовые и генетические паттерны на геномном уровне.

Другие анализы, основанные на геномных данных, не подходят для всесторонних исследований биоразнообразия, так как недостаточно универсальны и часто не являются устойчивыми, поскольку основаны на данных, которые нельзя комбинировать с результатами других исследований.

Тестируемый набор генов, точнее называемый «универсальные одноэкземплярные ортологи на уровне Metazoa» (metazoan USCOs), включает несколько сотен ядерных генов и может использоваться для всех многоклеточных животных. Этот метод явно превосходит ДНК-штрихкодирование — подход, который в настоящее время традиционно используется для идентификации видов и широко применяется в экологическом мониторинге.

До сих пор USCOs использовались для проверки полноты и качества секвенирования генома. Рабочая группа под руководством Дика Аренса, исследователя жуков и куратора коллекции Музея Кёнига, впервые успешно применила этот метод для разделения криптических видов, которые невозможно было различить с помощью обычных ДНК-штрихкодов.

Метод был протестирован на пауках, многоножках, лягушках, жуках, мухах, мелких паразитических осах и бабочках. Эти новые маркеры USCO можно получить как путем целевого секвенирования, так и путем извлечения из уже опубликованных и доступных в базах данных геномных данных. Это делает новый подход устойчивым и успешным.

Хотя в настоящее время метод дороже, чем обычное генетическое штрихкодирование, авторы предлагают metazoan USCOs в первую очередь в качестве дополнительного метода выбора для более сложных случаев. Таких случаев немало, особенно учитывая, что наука до сих пор даже близко не сошлась во мнении о том, сколько видов населяет Землю; оценки варьируются от 2 миллионов до 2 миллиардов видов.