Микробиомы морских нематод не зависят от родства, географии или типа питания

Морское дно буквально кишит нематодами: на квадратный метр осадка могут приходиться миллионы червей сотен видов.

Исследователи из Калифорнийского университета в Риверсайде изучили, могут ли микробиомы — микробные сообщества, связанные с более крупными хозяевами — помогать разным видам сосуществовать, снижая конкуренцию за пищу. Работа под руководством Холли Бик опубликована в журнале Molecular Ecology.

Ключевые выводы исследования:

• Вероятность сходства микробных профилей у нематод не коррелирует с тем, насколько близко они родственны.
• Микробиомы нематод не коррелируют с географическим регионом отбора проб (побережье Южной Калифорнии, Мексиканский залив, Арктика).
• Микробиомы не коррелируют с морфологией ротовых частей, по которой нематод традиционно делят на четыре "трофические группы".

Ход исследования:

Учёные проанализировали 281 особь из 33 родов. После микроскопической характеристики проводили ДНК-анализ, который давал генетический "снимок" микробиома каждой нематоды (бактерии, протисты, грибы и др.).

Неожиданные находки:

• Обнаружена ранее неизвестная ассоциация нематод с паразитами, включая миксомицеты.
• Часто встречалась связь нематод с бактериями, играющими ключевую роль в круговороте питательных веществ (углерод, азот, метан, сера).

Заключение:

"Наши результаты позволяют предположить, что в морских местообитаниях свободноживущие нематоды могут использовать более разнообразные и генералистские стратегии поиска пищи, чем считалось ранее", — заявила Холли Бик.

Таким образом, в отличие от некоторых насекомых (например, муравьёв-черепах) или лабораторных нематод, у морских свободноживущих нематод не обнаружено специализированных, унаследованных или регионально-зависимых микробиомов.