Геном Candida krusei раскрывает механизмы её природной устойчивости к флуконазолу

Дрожжи Candida krusei используются для ферментации какао-бобов, но также всё чаще обнаруживаются как патоген у пациентов с ослабленным иммунитетом. Этот вид обладает природной устойчивостью к флуконазолу — противогрибковому препарату первой линии.

В журнале G3 исследователи представили первую полногеномную последовательность клинического образца C. krusei. Ключом к успеху стало использование длинных прочтений при секвенировании, что позволило получить сборку с небольшим количеством скаффолдов.

Сравнение с патогеном C. albicans

• В геноме C. krusei обнаружено мало копий генов, ассоциированных с патогенностью у C. albicans (олигопептидные транспортеры, аспартильные протеазы, гены фосфолипазы B). Это согласуется с тем, что C. krusei редко вызывает заболевания.

Гены устойчивости к препаратам

• У C. krusei многие сайты, часто мутированные в мишени азольных препаратов у устойчивых штаммов C. albicans, не изменены. Это указывает на иной механизм природной устойчивости.
• Не найден ген MDR1, кодирующий транспортер, часто ответственный за множественную лекарственную устойчивость.
• Обнаружены копии генов, родственных CDR1 и CDR2, которые кодируют другие транспортеры, связанные с устойчивостью к препаратам. Их функция у C. krusei пока неизвестна.

Эти гены могут стать отправной точкой для изучения механизмов устойчивости C. krusei к противогрибковым средствам, что потенциально приведёт к разработке более эффективных методов лечения и профилактики для уязвимых групп пациентов.