Candida evolution disclosed: New insights into fungal infections
Глобальные грибковые инфекции, поражающие 1 миллиард человек и вызывающие 1,5 миллиона смертей ежегодно, становятся всё более актуальной проблемой. Это связано с ростом числа медицинских процедур (например, химиотерапии или лечения после трансплантации органов), которые ослабляют иммунную систему пациентов.
Лечение этих инфекций осложнено из-за появления устойчивых штаммов, ограниченного арсенала противогрибковых препаратов, а также их стоимости и побочных эффектов. Это создаёт острую потребность в более эффективных методах лечения.
Команда под руководством исследователя ICREA доктора Тони Габальдона из Института биомедицинских исследований (IRB Barcelona) и Барселонского суперкомпьютерного центра (BSC-CNS) выявила сотни генов, подвергшихся недавнему клинически значимому отбору у шести видов патогенного грибка Candida. Результаты опубликованы в журнале Nature Microbiology.
Анализ более 2000 геномов шести видов
Исследование охватило около 2000 геномов из клинических образцов шести основных видов Candida, хранящихся в публичных базах данных. Учёные сравнили эти геномы с референсными, создав обширный каталог генетических вариантов.
На основе предыдущих работ об устойчивых штаммах было проведено полногеномное исследование ассоциаций (GWAS). Оно выявило генетические варианты, связанные с устойчивостью к противогрибковым препаратам у клинических изолятов. Это дало представление как об известных, так и о новых механизмах устойчивости к семи препаратам у трёх видов Candida.
Тревожным открытием стал потенциальный путь распространения устойчивости — скрещивание между чувствительными и устойчивыми штаммами, что способствует росту числа резистентных патогенов.
Кроме того, сосредоточившись на недавно приобретённых вариантах среди клинических штаммов, исследователи обнаружили общие и видоспецифичные генетические признаки недавнего отбора. Они показывают, какие адаптации могут быть необходимы для процветания и распространения в среде, связанной с человеком.
Помимо новых данных об адаптации Candida, исследование предоставляет ценный ресурс — комплексный каталог вариантов, признаков отбора и факторов лекарственной устойчивости. Эти знания закладывают основу для будущих экспериментов и потенциального прогресса в разработке более эффективных методов лечения кандидозных инфекций.