ИИ HCPL точно и быстро определяет локализацию и экспрессию белков в клетках

Новая система искусственного интеллекта HCPL (Hybrid subCellular Protein Localizer), разработанная в Институте ИИ, ориентированного на человека, Университета Суррея, продемонстрировала высочайшую в мире точность и скорость в определении белковых паттернов внутри отдельных клеток. Это может помочь учёным понять различия в раковых опухолях и найти новые лекарства.

В исследовании, опубликованном в Communications Biology, показано, что HCPL для обучения расшифровке локализации белков в клеточных структурах и их поведения требуется лишь частично размеченные данные.

Команда протестировала HCPL на Атласе белков человека (Human Protein Atlas) и обнаружила, что это самый точный инструмент для определения локализации белков внутри отдельных клеток.

Как работает HCPL и зачем это нужно

• Профессор Мирослав Бобер, руководитель проекта: «HCPL использует модель глубокого обучения для быстрого и точного определения субклеточных структур, где присутствуют белки. Это упрощает сложный и трудоёмкий процесс изучения белков».
• Пространственная протеомика — область, изучающая распределение белков в клетках с помощью экспериментальных методов (например, флуоресцентной микроскопии) и вычислительных подходов.
• ИИ наносит белки на карту отдельных клеточных компартментов (органелл), что помогает понять их функции и раскрыть сложные внутренние процессы клетки.

Партнёрство и перспективы

Система разработана совместно с компанией ForecomAI, специализирующейся на машинном обучении для здравоохранения и бионаук.

• Доктор Амайя Ирисар, директор ForecomAI: «Расшифровка распределения белков жизненно важна для понимания их функций и разработки новых методов лечения. Наша работа позволяет масштабировать этот процесс и открывает новые горизонты».