Генетическая головоломка знаменитого цветка разгадана

Ученые из UNSW впервые собрали полный геном Telopea speciosissima — новозеландского варaтаха, цветочной эмблемы штата Новый Южный Уэльс. Исследование, опубликованное в журнале Molecular Ecology Resources, стало первым результатом инициативы Genomics for Australian Plants.

Первый геном в семействе

Несмотря на культурное, коммерческое и экологическое значение, у варaтаха не было референсного генома, как и у большинства из более чем 1500 видов его семейства Proteaceae. Стефани Чен, руководившая проектом, сравнила секвенирование генома со сборкой пазла из миллиардов частей без картинки на коробке. Использование трех различных технологий секвенирования позволило собрать этот "пазл".

Значение для науки и сохранения видов

Ученые не только секвенировали геном, но и реконструировали структуру одиннадцати хромосом варaтаха. Как отметил доктор Ричард Эдвардс, это позволяет изучать эволюцию на новом уровне и понимать, как образовались разные виды варaтахов.

Образцы листьев для исследования были взяты с растения, произраставшего на территории Ботанического сада Голубых гор Маунт-Тома до масштабных лесных пожаров 2019/2020 годов. Растение, пережившее пожар благодаря способности регенерировать из лигнотубера, было размножено и теперь войдет в живую коллекцию сада.

Платформа для будущих исследований

Доктор Джейсон Брэгг подчеркнул, что этот референсный геном станет важной платформой для эволюционной геномики и сохранения австралийской флоры. Он поможет в охране исчезающих видов и восстановлении популяций.

Это достижение — часть работы Австралийского института ботанической науки, направленной на защиту и сохранение жизненно важной флоры континента. Референсный геном Telopea speciosissima будет представлен в экспозиции нового Национального гербария Нового Южного Уэльса.

2022-01-12