Новый метод чтения полных геномов из малого количества биоматериала

В Уппсальском университете разработан усовершенствованный метод чтения и интерпретации геномов организмов, которые сложно исследовать. Группа учёных под руководством доктора Анны Рослинг применила этот метод для расшифровки генетической информации грибов, присутствующих в окружающей среде, что может быть важно, например, для роста растений.

Многие организмы на нашей планете трудно исследовать, так как они крошечные и учёные не знают, как выращивать их в лаборатории. Однако эти организмы могут быть полезны — производить терапевтические вещества или повышать продуктивность полей и плодовых деревьев.

Современные мощные методы чтения генетической информации (секвенирования ДНК) обычно требуют значительного количества исследуемого организма. Это затруднительно, когда организм присутствует в окружающей среде в ограниченных количествах или находится в смеси с другими похожими видами.

Изучение нитчатых грибов, образующих длинные разветвлённые трубки с множеством генетически различных ядер, было особенно сложным. Новый метод, описанный Монтолиу-Нерин и соавторами, предлагает эффективное решение этой проблемы.

Вместе с SciLifeLab, исследовательской инфраструктурой для молекулярных бионаук, они разработали сложную процедуру для выделения отдельных ядер и применили к ним инструменты секвенирования ДНК. Достигнутый уровень чувствительности позволил получить полные, полностью собранные геномы всего из пяти или шести ядер.

Хотя метод разработан для исследования грибов, его можно применять к любому организму, что делает это технологическое достижение полезным для всего научного сообщества.

Исследование опубликовано в журнале Scientific Reports и находится в свободном доступе в сети.