Улучшенный метод измерения генов

Учёные из LMU разработали метод для более эффективного измерения активности генов, что позволяет лучше понимать биологические процессы.

Активность генов определяется по наличию молекул матричной РНК (mRNA), которые служат инструкцией для синтеза белков. Метод высокопроизводительного секвенирования "RNA-seq" позволяет измерить весь спектр mRNA (транскриптом) в образце, подсчитывая копии для каждого гена. Это один из ключевых инструментов молекулярной биологии.

Биолог LMU Вольфганг Энард и его команда разработали, возможно, самый эффективный на данный момент метод RNA-seq, названный prime-seq. Он уже успешно применён в более чем 30 публикациях.

В статье в журнале Genome Biology показано, что prime-seq измеряет транскриптом так же точно, как и другие протоколы RNA-seq, но при этом до 50 раз экономичнее.

Эффективность метода основана на интеграции ДНК-штрихкодов и прямом выделении mRNA из клеток. Метод можно внедрить в любой молекулярно-биологической лаборатории без дорогого оборудования.

Как отмечает один из ведущих авторов исследования Лукас Ванге, надёжные, проверенные и экономичные методы становятся всё важнее. Учёные надеются, что их метод также внесёт вклад в большую открытость и воспроизводимость в науке.