Расшифрован геном стерляди

Стерлядь (Acipenser ruthenus), как и другие осетровые, считается "живым ископаемым". Палеонтологические данные указывают, что эти рыбы существуют около 250 миллионов лет и за это время почти не изменились внешне.

Учёные из Вюрцбургского университета и Института пресноводной экологии и внутреннего рыболовства им. Лейбница (IGB) совместно с коллегами из Констанца, Франции и России впервые секвенировали геном стерляди. Исследование, опубликованное в журнале Nature Ecology and Evolution, показало, что генетический материал этих рыб также крайне консервативен.

Ключевые выводы исследования

• Медленная эволюция: Скорость эволюции белков у стерляди оказалась очень низкой, сравнимой с таковой у латимерии (целаканта) и акул — видов, также мало менявшихся сотни миллионов лет.
• Древнее удвоение генома: Около 180 миллионов лет назад у предков стерляди произошло полное удвоение генома (тетраплоидизация). Удивительно, что за столь долгий срок геном не вернулся к диплоидному состоянию и не подвергся значительной редукции, а сохранил высокую степень структурной и функциональной полиплоидии.
• Параметры генома: Геном стерляди содержит 120 хромосом, примерно 47 500 генов, кодирующих белки, и состоит из 1,8 миллиарда пар оснований.
• Эволюционное значение: Осетровые являются предками более 30 000 современных видов костистых рыб, что составляет более 96% всех ныне живущих рыб и около половины всех позвоночных. Их геном — важный недостающий элемент для понимания эволюции позвоночных.

Практическое значение

Расшифровка генома — важный шаг для сохранения осетровых, большинство видов которых находятся на грани исчезновения. В частности, она позволит:

• Определять пол особей с помощью генетического анализа, что критически важно для управления размножающимися популяциями в аквакультуре.
• Поддерживать усилия по восстановлению диких популяций, обеспечивая рынок продукцией аквакультуры и снижая давление на природные запасы.