Получен высококачественный геном рыбы-клоуна для биологических исследований

Ученые из Окинавского института науки и технологий (OIST) собрали наиболее полный и качественный на сегодня геном ложной рыбы-клоуна (Amphiprion ocellaris). Исследование опубликовано в журнале G3 Genes|Genomes|Genetics.

Этот геном, который является «инструкцией» для каждой клетки рыбы, собран на уровне хромосом. Ранее опубликованные версии состояли из разрозненных фрагментов генов без понимания их расположения на хромосомах.

Почему это важно:

• Рыбы-клоуны — модельный вид для изучения экологии, эволюции, адаптации и биологии развития.
• Вид обитает в тропиках и субтропиках, зависит от анемонов и коралловых рифов, популяции которого могут сокращаться из-за климатических изменений.
• Ложный клоун внешне похож на оранжевого клоуна (настоящего «Немо»), но они живут в разных регионах. Геном оранжевого клоуна был опубликован ранее, что позволяет проводить сравнительные исследования.

Ключевое открытие:

Сравнив геномы двух видов клоунов с геномами остальных 26 видов рыб-анемонов, ученые обнаружили 70 генов, которые сохранились у обоих клоунов, но отсутствуют или отличаются у других видов. Подмножество этих генов связано с нейробиологическими функциями, что, вероятно, влияет на уникальное поведение и экологию двух видов клоунов.

Перспективы:

Полученный геном — это новый базовый ресурс для экспериментов, в том числе для исследований влияния климатических изменений на коралловых рыб.