Расшифровка генома риновируса — возбудителя простуды

Новое исследование учёных Университета Бригама Янга, посвящённое вирусу, вызывающему почти половину всех случаев простуды, объясняет, как и где происходит эволюция в геноме риновируса и что это означает для создания возможных вакцин.

Исследование опубликовано в апрельском выпуске научного журнала Molecular Biology and Evolution.

«Существует много различных подходов к лечению простуды, ни один из которых не кажется эффективным, — сказал профессор биологии и соавтор работы Кит Крэндалл. — Отчасти это связано с тем, что мы не уделяли много времени изучению самого вируса и его истории, чтобы понять, как он реагирует на иммунную систему человека и лекарства».

Команда изучила общедоступные геномные последовательности и с помощью компьютерных алгоритмов оценила, как риновирус связан с другими вирусами.

По словам ведущего автора исследования, постдока кафедры биологии Никол Льюис-Роджерс, риновирус похож на вирус полиомиелита, вакцина от которого была создана в 1955 году. Но если у вируса полиомиелита всего три подвида, то у риновируса их более 100, и они постоянно эволюционируют.

«Эти вирусы могут находиться под одинаковым давлением, но меняться по-разному, — пояснила Льюис-Роджерс. — Именно поэтому так сложно создать вакцину».

С помощью компьютерной программы, разработанной в университете, команда смогла идентифицировать участки генома вируса, которые обеспечивают устойчивость к лекарствам и иммунной системе человека.

Иммунная система хорошо распознаёт вирусные частицы и избавляется от них, как и новые лекарства, но риновирус ответил на эти защитные механизмы, изменив свой геном так, чтобы его было не так легко распознать.

«Вирус эволюционирует, находя решения против иммунной системы и лекарств, — сказал Крэндалл. — Чем больше мы узнаём о том, как вирус находит эти решения, тем лучше мы сможем избавлять организм от этих инфекций».

Понимание того, где происходят изменения в геноме вируса, поможет вирусологам, работающим над созданием препаратов, нацеленных на риновирус.

«Если у вас есть 10 000 единиц информации, это сужает поиск до горстки, — сказала Льюис-Роджерс. — Вот где можно начинать искать».

Льюис-Роджерс и Крэндалл надеются, что учёные используют эти данные для создания более эффективных препаратов для борьбы с вирусом.

Источник: Brigham Young University