Немецкие исследователи опубликовали полный геном неандертальца

Институт эволюционной антропологии Макса Планка в Лейпциге завершил секвенирование генома неандертальца и предоставляет полную последовательность научному сообществу.

В 2010 году группа доктора Сванте Паабо представила первый черновой вариант генома неандертальца по данным из трёх костей из хорватской пещеры. Теперь они использовали кость пальца ноги, найденную в 2010 году в Денисовой пещере на юге Сибири, чтобы получить высококачественный геном от одной особи неандертальца.

Команда из Лейпцига применила разработанные за последние два года чувствительные методы, чтобы секвенировать каждую позицию в геноме примерно 50 раз, используя ДНК, извлечённую из 0,038 грамма кости пальца. Анализ показывает, что эта особь тесно связана с другими неандертальцами Европы и западной России. Примечательно, что и неандертальцы, и их родственники — денисовцы — присутствовали в этой уникальной пещере в горах Алтая.

В черновой версии 2010 года каждая позиция определялась в среднем один раз. В завершённой версии каждая позиция определена в среднем 50 раз. Это позволяет различить даже небольшие различия между копиями генов, которые эта особь унаследовала от матери и отца. Полная последовательность генома теперь доступна научному сообществу через интернет.

"Геном очень высокого качества, — говорит доктор Кай Прюфер, координирующий анализ. — Он соответствует качеству генома денисовца, представленного в прошлом году, и так же хорош или даже лучше, чем доступные на сегодня геномы современных людей".

"Мы сравниваем этот геном неандертальца с геномом денисовца, а также с черновиками геномов других неандертальцев. Мы получим представление о многих аспектах истории как неандертальцев, так и денисовцев, и уточним наши знания о генетических изменениях, которые произошли в геномах современных людей после их расхождения с предками неандертальцев и денисовцев", — говорит Паабо. Группа представит статью с описанием генома позже в этом году, но уже сейчас делает последовательность свободно доступной.

Проект стал возможен благодаря финансированию Общества Макса Планка и является частью почти 30-летних усилий группы Паабо по изучению древней ДНК. Кость пальца была обнаружена профессорами Анатолием Деревянко и Михаилом Шуньковым из РАН в 2010 году во время раскопок в Денисовой пещере, где культурные слои указывают на начало человеческого присутствия до 280 000 лет назад.