Первый полный геном сорта бобовых Faba Granja Asturiana опубликован

Исследователи из команды генетики растений Региональной службы агропродовольственных исследований и развития Астурии (Serida) опубликовали первую версию генома сорта Faba Granja Asturiana. Этот прорыв важен для генетического улучшения и сохранения одного из самых знаковых бобовых Астурии.

Работа опубликована в журнале Data in Brief под названием "Chromosome-level dataset from de novo assembly of a Fabada common bean genotype using Illumina and PacBio technologies" и стала результатом проекта SUSTCROP.

Исследователи утверждают, что эта работа — ключевой шаг для генетического улучшения и сохранения сорта. Она позволит точнее идентифицировать его характеристики, изучать эволюцию вида и предоставит прочную основу для оптимизации программ генетического улучшения, способствуя созданию более продуктивных и устойчивых сортов.

Для программ селекции растений наличие референсных геномов необходимо, так как они дают точную молекулярную основу для понимания ДНК (структуры, функции и изменчивости). Это позволяет выявить сеть генов, связанных с ключевыми агрономическими признаками, такими как урожайность, устойчивость к болезням, толерантность к стрессу или качество плодов.

На сегодня в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) были опубликованы полные геномы девяти различных сортов фасоли обыкновенной (Phaseolus vulgaris). Геном Faba Granja Asturiana (сорт Andecha) стал десятым доступным геномом для этого вида. Этот новый генетический ресурс внесет вклад в построение пангенома фасоли обыкновенной — полного каталога генов вида.

Это знание также позволит точнее определить генетические особенности, специфичные для этого местного сорта (Faba Granja Asturiana, сорт Andecha), которые не всегда отражены в референсном геноме вида. Эти особенности контролируют, например, размер семян, высокое качество зерна или большую восприимчивость к определенным вредителям и болезням.

Кроме того, оно предоставит важную информацию для изучения эволюции вида и прочную основу для ускорения программ генетического улучшения.

Исследовательская группа уже работает над публикацией аннотации генома — процесса идентификации и описания генов на каждой хромосоме и их возможных биологических функций. Этот шаг дополнит текущую сборку и даст более детальное представление о генетической основе уникальных морфологических характеристик этого местного сорта.