Расшифрован геном мезоамериканской фасоли
Международная команда учёных из Иберо-Америки расшифровала геном мезоамериканской разновидности фасоли (Phaseolus vulgaris). Это достижение совпало с объявлением ООН 2016 года Международным годом зернобобовых. Расшифровка генома этого важного источника растительного белка станет ключом к улучшению производства фасоли и сохранению её генетического разнообразия в регионе. Результаты опубликованы в журнале Genome Biology.
Фасоль — одна из древнейших сельскохозяйственных культур, одомашненная в Америке тысячи лет назад. По данным Продовольственной и сельскохозяйственной организации ООН (FAO), обыкновенная фасоль — самый важный вид зернобобовых, на который приходится 50% потребляемых в мире бобовых зерен. Её выращивают в Латинской Америке, Африке, на Ближнем Востоке, в Китае, Европе, США и Канаде.
Проект был инициирован Иберо-американской программой развития науки и технологий (CYTED) и объединил учёных из Аргентины, Бразилии, Мексики и Испании. Руководителями выступили Альфредо Эррера-Эстрелья (Национальная лаборатория геномики биоразнообразия, Мексика), Родерик Гуиго (Центр геномной регуляции, Испания) и Тони Габальдон (Центр геномной регуляции, Испания).
Для секвенирования была выбрана мезоамериканская линия BAT93, имеющая значение для выведения коммерческих сортов. Учёные создали технологическую платформу, позволившую секвенировать и собрать последовательность длиной 620 миллионов пар оснований. В геноме было идентифицировано 30 491 ген, а также проанализированы паттерны их экспрессии («когда» и «где» они работают). Исследователи также определили ключевые эволюционные события, сформировавшие современную фасоль.
«Последовательность генома фасоли, как андской (расшифрованной ранее), так и мезоамериканской, определённо поможет идентифицировать гены, связанные с устойчивостью к болезням, засухе и засолению, фиксацией азота, формированием репродуктивных клеток и качеством семян», — заявил Родерик Гуиго.
На следующем этапе проекта планируется секвенировать геномы как минимум дюжины других сортов фасоли и её близких родственников, что позволит выявить гены, связанные с доместикацией.
Проект PhasIbeAm по секвенированию мезоамериканской фасоли был запущен в 2009 году. Его общий бюджет составил 2,482,000 долларов США, финансирование предоставили научные министерства и советы Аргентины, Бразилии, Испании, Мексики и программа CYTED.