Учёные составили полную карту генома последнего вида дикой лошади

Исследователи из Университета Миннесоты успешно секвенировали полный геном находящейся под угрозой исчезновения лошади Пржевальского. Этот вид, некогда вымерший в дикой природе, сейчас насчитывает около 2000 особей благодаря усилиям по сохранению.

Исследование, опубликованное в журнале G3: Genes, Genomes, Genetics, возглавили Николь Флэк и Лорен Хьюз из Колледжа ветеринарной медицины, а также профессор Кристофер Фолк из Колледжа пищевых, сельскохозяйственных и природных ресурсов. Студенты университета участвовали в секвенировании генома в рамках курса Фолка по животноводству.

«Геном — это базовый план животного, который говорит нам, что делает вид уникальным, а также о здоровье популяции», — сказал Фолк. — «Мои студенты совместно создали геном лошади Пржевальского самого высокого качества в мире».

Теперь исследователи могут использовать эту работу как инструмент для точных прогнозов о том, что означают генетические мутации для здоровья и сохранения вида.

«Изучать гены без хорошего референса — всё равно что собирать пазл из 3 миллиардов частей без картинки на коробке», — пояснила Флэк. — «Исследователям, изучающим мутации в важном гене у лошади Пржевальского, нужна хорошая референсная картинка, чтобы сравнить с ней свой пазл».

Для построения репрезентативной карты генов вида учёные использовали образец крови 10-летней кобылы Варушки из зоопарка Миннесоты. Этот зоопарк давно участвует в разведении и управлении популяцией лошадей Пржевальского — с 1970-х годов там родилось более 50 жеребят.

«Мы были рады сотрудничать с Университетом Миннесоты для сохранения генетического здоровья вида по мере восстановления его популяций как в зоопарках, так и в дикой природе», — сказала ветеринарный врач Энн Ривас. — «Мы счастливы предложить нашему сообществу возможность увидеть лошадь как результат наших усилий по сохранению».

Для построения генома использовалась передовая технология секвенирования с помощью небольшого прибора размером с банку газировки. Его портативность означает, что этот метод можно адаптировать для дальнейшего изучения диких лошадей Пржевальского в отдалённых местах.

Будущее применение референсного генома может включать:

• Изучение генов, помогающих лошади адаптироваться к изменениям окружающей среды.
• Выявление мутаций, связанных с определёнными признаками или заболеваниями.
• Информирование будущих решений по разведению для улучшения генетического разнообразия.

Учитывая крайнее узкое «бутылочное горлышко» популяции, через которое прошёл вид во время почти полного вымирания, такое понимание имеет решающее значение для продолжения программ разведения.