Расшифрован геном национального цветка Сингапура

Учёные из Института геномики A*STAR (GIS) и Института биоразнообразия и медицины SingHealth Duke-NUS (BD-MED) впервые расшифровали полный генетический код национального цветка Сингапура — орхидеи Papilionanthe Miss Joaquim, также известной как Ванда Мисс Джоаким (VMJ). Химический анализ, основанный на данных генома, выявил наличие природных соединений, таких как флавонолы и антоцианы, известных своими антиоксидантными свойствами и влиянием на окраску. Исследование опубликовано в журнале Communications Biology 15 сентября 2022 года.

Для сборки генома VMJ были использованы различные технологии генетического секвенирования. В результате был получен геном из 19 хромосом общей длиной 2.4 миллиарда пар нуклеотидных оснований, содержащий около 32 000 генов. Эти гены влияют на синтез белков, определяющих признаки орхидеи и клеточные процессы.

Знание генома позволило провести химическое профилирование и обнаружить:

• Флавонолы и антоцианы — соединения, ответственные за антиоксидантные свойства и характерную окраску цветка.
• Вандатерозиды — биоактивное соединение, способное замедлять процесс старения кожи. Ранее оно было обнаружено в Papilionanthe Teres, материнском виде для гибрида VMJ.

Значение исследования:

• Наследие: Расшифровка генетического кода национального цветка является вкладом в национальное наследие Сингапура.
• Биоразнообразие: Работа знаменует начало изучения и сохранения геномов местной флоры, которая насчитывает более 4000 видов, находящихся под угрозой.
• Будущие исследования: Полученные данные о геноме открывают путь для исследований в области генной и метаболической инженерии, а также для поиска природных биоактивных соединений для медицинских целей.