Секвенирование генома атлантического лосося опубликовано в Nature

Международная исследовательская группа, в которую входит профессор Уилли Дэвидсон из Университета Саймона Фрейзера (SFU), представила высококачественную референсную последовательность генома атлантического лосося. Работа опубликована в журнале Nature.

Ключевые характеристики генома:

• Размер: 2.97 гигабазы (сопоставимо с человеческим геномом).
• Содержит около 37 000 генов, расположенных на 29 хромосомах.

Это достижение позволяет применять к дикому и фермерскому лососю технологии, разработанные для человека.

Научное значение:

Геном атлантического лосося уже помог уточнить геном радужной форели и служит основой для секвенирования других лососевых (например, кижуча и арктического гольца). Теперь этот вид можно ставить в один ряд с домашними животными (крупный рогатый скот, свиньи, куры), чьи геномы используются для улучшения производства.

Эволюционная особенность:

Исследователи охарактеризовали событие полногеномной дупликации (Whole Genome Duplication, WGD), произошедшее в линии лососевых около 80 миллионов лет назад. Это четвертая такая дупликация, которая позволила лососевым удвоить набор генов и расширить взаимодействие генов со средой. Хотя геном постепенно возвращается к стабильному состоянию, следы дупликации сохраняются до сих пор.

Международное сотрудничество:

Исследование "The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization" — результат работы международного консорциума ICSASG (International Cooperation to Sequence the Atlantic Salmon Genome) с участием учёных из Канады, Чили и Норвегии.

Практическая польза:

Созданные референсный геном и атлас генов станут новой научной базой для улучшения и понимания рыболовства, охраны природы, экологии, физиологии, эволюции и аквакультуры более чем 70 видов лососевых, имеющих экономическое, культурное и экологическое значение. Теперь гены лосося и возможности для устойчивого рыбоводства и управления дикими популяциями доступны "в один клик мыши".