Новое исследование уточняет временную шкалу эволюции млекопитающих

Новое исследование, опубликованное в журнале Nature, предоставило самую детальную на сегодняшний день временную шкалу эволюции млекопитающих.

Исследование описывает новый быстрый вычислительный подход для получения точно датированных эволюционных деревьев («таймтри»). Авторы использовали этот метод для анализа геномных данных млекопитающих, чтобы ответить на давний вопрос: возникли ли современные группы плацентарных млекопитающих до или после мел-палеогенового (K-Pg) массового вымирания, которое уничтожило более 70% всех видов, включая всех динозавров.

Результаты подтверждают, что предки современных групп плацентарных млекопитающих появились после K-Pg вымирания, произошедшего 66 миллионов лет назад, что разрешает давнюю дискуссию о происхождении современных млекопитающих. Плацентарные млекопитающие — самая разнообразная группа ныне живущих млекопитающих, включающая приматов, грызунов, китообразных, хищных, рукокрылых (летучих мышей) и человека.

Исследовательская группа под руководством доктора Марио дос Рейса (Лондонский университет королевы Марии) и профессора Фила Доногью (Бристольский университет) разработала новый быстрый байесовский подход для анализа больших наборов геномных последовательностей с учётом неопределённости в данных.

Ключевые выводы и метод:

• Ответ на главный вопрос: Современные группы плацентарных млекопитающих диверсифицировались после вымирания динозавров.
• Новый вычислительный метод: Позволил проанализировать гигантский набор данных, включающий генетическую информацию почти 5000 видов млекопитающих и 72 полных генома.
• Эффективность: Подход сократил время вычислений для такого сложного анализа с десятилетий до месяцев и уменьшил его в 100 раз по сравнению с использованием стандартных методов на суперкомпьютере.
• Экологический аспект: Повышенная эффективность метода также существенно сокращает выбросы CO₂, связанные с вычислениями.

Доктор Сандра Альварес-Карретеро, ведущий автор статьи из UCL: «Интегрировав полные геномы в анализ и необходимую палеонтологическую информацию, мы смогли уменьшить неопределённости и получить точную эволюционную шкалу времени. Мы теперь имеем определённый ответ».

Профессор Доногью, соавтор: «Наша точная шкала времени разрешает этот вопрос».

Новый метод может быть использован для изучения других спорных эволюционных временных шкал, требующих анализа больших данных. В сочетании с грядущими геномами от проектов «Дарвиновское древо жизни» и «Earth BioGenome» он приближает возможность построения надёжной временной шкалы для всего Древа жизни.