Расшифровка секретов вируса Эбола

В июне прошлого года, на ранних этапах вспышки Эболы в Западной Африке, исследователи провели секвенирование генома смертельного вируса с беспрецедентным масштабом и скоростью. Их результаты выявили ряд критически важных фактов по мере развития вспышки, включая передачу вируса только при контакте между людьми и накопление новых мутаций в ходе множественных передач.

Чтобы ответить на оставшиеся вопросы, международная команда из Гарвардского университета, Института Броуда, CDC, NIAID (часть NIH) и других учреждений секвенировала более 200 дополнительных геномов из образцов вируса Эбола. Это позволило получить наиболее полную картину того, как вирус передавался и как менялся в ходе длительной вспышки.

В рамках усилий по улучшению глобального реагирования команда публиковала свои данные в открытом доступе по мере их получения в прошлом году. "Одним из самых ценных аспектов работы в этом реагировании на вспышку стали связи, которые мы установили с множеством выдающихся людей благодаря открытому обмену данными", — сказала старший автор Пардис Сабети. Анализ команды был описан в статье, опубликованной 18 июня в журнале Cell.

Ключевые выводы исследования:

• Ограниченный межграничный обмен: Данные высокого разрешения показали, что на поздних этапах вспышки практически не было межграничного обмена вирусом между тремя основными пострадавшими странами — Сьерра-Леоне, Либерией и Гвинеей. Это свидетельствует о том, что меры по сдерживанию вспышки на границах могут быть эффективными.
• Эволюция вируса: В начале вспышки, когда вирус быстро распространялся, он накопил множество мутаций, значительная часть которых могла влиять на функцию белков. Со временем многие из этих мутаций не сохранились, а скорость изменений в геноме вируса вернулась к ожидаемой для долгосрочной перспективы. "Вирус Эбола начал отсеивать мутации, которые ему не выгодны", — отметил ведущий автор Дэнни Парк.
• Новые взаимодействия: В некоторых пациентах были обнаружены признаки редактирования вирусного генома человеческими ферментами. Ранее такое наблюдалось только у вирусов, давно взаимодействующих с людьми, но никогда — у вируса Эбола.

"Множество мутаций, которые мы увидели в начале вспышки, и эволюция, которую мы наблюдали в долгосрочной перспективе, ранее отмечались у других вирусов, а геномные данные лишь помогают проиллюстрировать известные эволюционные явления", — говорит Сабети. "Данные просто напоминают нам то, что мы всегда знали: мы должны свести эту вирусную линию к нулю".